Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms