Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc18Q640L5 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc18Q640L5 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc18Q640L5 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc18Q640L5 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc18Q640L5 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc18Q640L5 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc18Q640L5 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc18Q640L5 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ccdc18Q640L5 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
Ccdc18Q640L5 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ccdc18Q640L5 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ccdc18Q640L5 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
Ccdc18Q640L5 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ccdc18Q640L5 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ccdc18Q640L5 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
Ccdc18Q640L5 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
Ccdc18Q640L5 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ccdc18Q640L5 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ccdc18Q640L5 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ccdc18Q640L5 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc18Q640L5 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc18Q640L5 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc18Q640L5 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc18Q640L5 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc18Q640L5 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc18Q640L5 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc18Q640L5 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc18Q640L5 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc18Q640L5 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc18Q640L5 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc18Q640L5 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc18Q640L5 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc18Q640L5 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc18Q640L5 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc18Q640L5 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc18Q640L5 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc18Q640L5 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc18Q640L5 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc18Q640L5 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc18Q640L5 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc18Q640L5 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc18Q640L5 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc18Q640L5 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc18Q640L5 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc18Q640L5 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc18Q640L5 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc18Q640L5 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc18Q640L5 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc18Q640L5 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc18Q640L5 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc18Q640L5 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc18Q640L5 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc18Q640L5 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc18Q640L5 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc18Q640L5 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc18Q640L5 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc18Q640L5 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc18Q640L5 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc18Q640L5 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc18Q640L5 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc18Q640L5 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc18Q640L5 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc18Q640L5 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc18Q640L5 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc18Q640L5 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc18Q640L5 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc18Q640L5 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc18Q640L5 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc18Q640L5 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc18Q640L5 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc18Q640L5 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc18Q640L5 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc18Q640L5 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc18Q640L5 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc18Q640L5 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc18Q640L5 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc18Q640L5 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc18Q640L5 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc18Q640L5 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc18Q640L5 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc18Q640L5 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc18Q640L5 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc18Q640L5 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc18Q640L5 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc18Q640L5 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc18Q640L5 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc18Q640L5 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc18Q640L5 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc18Q640L5 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc18Q640L5 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc18Q640L5 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc18Q640L5 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc18Q640L5 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc18Q640L5 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc18Q640L5 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc18Q640L5 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc18Q640L5 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc18Q640L5 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc18Q640L5 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
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