Protein–RNA interactions for Protein: Q61739

Itga6, Integrin alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga6Q61739 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Itga6Q61739 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Itga6Q61739 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Itga6Q61739 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Itga6Q61739 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Itga6Q61739 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Itga6Q61739 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Itga6Q61739 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Itga6Q61739 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Itga6Q61739 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Itga6Q61739 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Itga6Q61739 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Itga6Q61739 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Itga6Q61739 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Itga6Q61739 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Itga6Q61739 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Itga6Q61739 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Itga6Q61739 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Itga6Q61739 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Itga6Q61739 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Itga6Q61739 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itga6Q61739 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itga6Q61739 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itga6Q61739 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itga6Q61739 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itga6Q61739 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itga6Q61739 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itga6Q61739 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itga6Q61739 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itga6Q61739 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itga6Q61739 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Itga6Q61739 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itga6Q61739 Gm20815-201ENSMUST00000115496 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itga6Q61739 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Itga6Q61739 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Itga6Q61739 Gm21812-202ENSMUST00000188908 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itga6Q61739 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itga6Q61739 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Itga6Q61739 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itga6Q61739 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itga6Q61739 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Itga6Q61739 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Itga6Q61739 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itga6Q61739 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itga6Q61739 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itga6Q61739 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itga6Q61739 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itga6Q61739 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itga6Q61739 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itga6Q61739 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Itga6Q61739 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itga6Q61739 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itga6Q61739 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itga6Q61739 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itga6Q61739 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Itga6Q61739 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itga6Q61739 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Itga6Q61739 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itga6Q61739 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itga6Q61739 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itga6Q61739 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itga6Q61739 Gm37720-201ENSMUST00000195497 1241 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Itga6Q61739 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Itga6Q61739 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Itga6Q61739 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itga6Q61739 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itga6Q61739 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itga6Q61739 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itga6Q61739 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itga6Q61739 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itga6Q61739 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itga6Q61739 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itga6Q61739 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itga6Q61739 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itga6Q61739 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itga6Q61739 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itga6Q61739 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itga6Q61739 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itga6Q61739 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itga6Q61739 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itga6Q61739 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itga6Q61739 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itga6Q61739 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itga6Q61739 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itga6Q61739 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itga6Q61739 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itga6Q61739 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itga6Q61739 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itga6Q61739 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itga6Q61739 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itga6Q61739 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itga6Q61739 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itga6Q61739 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itga6Q61739 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itga6Q61739 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itga6Q61739 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itga6Q61739 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itga6Q61739 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itga6Q61739 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itga6Q61739 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms