Protein–RNA interactions for Protein: Q61660

Foxj1, Forkhead box protein J1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxj1Q61660 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Foxj1Q61660 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Foxj1Q61660 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC13.9□□□□□ -0.19
Foxj1Q61660 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Foxj1Q61660 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Foxj1Q61660 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Foxj1Q61660 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Foxj1Q61660 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Foxj1Q61660 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Foxj1Q61660 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Foxj1Q61660 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Foxj1Q61660 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Foxj1Q61660 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Foxj1Q61660 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Foxj1Q61660 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Foxj1Q61660 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Foxj1Q61660 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Foxj1Q61660 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Foxj1Q61660 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Foxj1Q61660 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Foxj1Q61660 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Foxj1Q61660 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Foxj1Q61660 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Foxj1Q61660 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Foxj1Q61660 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Foxj1Q61660 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Foxj1Q61660 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Foxj1Q61660 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Foxj1Q61660 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Foxj1Q61660 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Foxj1Q61660 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Foxj1Q61660 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Foxj1Q61660 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Foxj1Q61660 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Foxj1Q61660 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Foxj1Q61660 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Foxj1Q61660 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Foxj1Q61660 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Foxj1Q61660 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Foxj1Q61660 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Foxj1Q61660 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Foxj1Q61660 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Foxj1Q61660 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Foxj1Q61660 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Foxj1Q61660 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Foxj1Q61660 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Foxj1Q61660 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Foxj1Q61660 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Foxj1Q61660 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Foxj1Q61660 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Foxj1Q61660 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Foxj1Q61660 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Foxj1Q61660 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Foxj1Q61660 Xlr-203ENSMUST00000114810 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Foxj1Q61660 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Foxj1Q61660 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Foxj1Q61660 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Foxj1Q61660 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Foxj1Q61660 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Foxj1Q61660 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Foxj1Q61660 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Foxj1Q61660 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Foxj1Q61660 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Foxj1Q61660 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Foxj1Q61660 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Foxj1Q61660 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Foxj1Q61660 Xlr-201ENSMUST00000067763 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Foxj1Q61660 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Foxj1Q61660 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Foxj1Q61660 Gm18719-201ENSMUST00000196696 1413 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Foxj1Q61660 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Foxj1Q61660 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Foxj1Q61660 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Foxj1Q61660 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Foxj1Q61660 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Foxj1Q61660 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Foxj1Q61660 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Foxj1Q61660 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Foxj1Q61660 Gm29644-201ENSMUST00000189003 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Foxj1Q61660 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Foxj1Q61660 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Foxj1Q61660 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Foxj1Q61660 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Foxj1Q61660 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Foxj1Q61660 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Foxj1Q61660 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Foxj1Q61660 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Foxj1Q61660 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Foxj1Q61660 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Foxj1Q61660 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Foxj1Q61660 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Foxj1Q61660 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Foxj1Q61660 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Foxj1Q61660 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Foxj1Q61660 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Foxj1Q61660 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Foxj1Q61660 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
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