Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms