Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Samhd1Q60710 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Samhd1Q60710 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Samhd1Q60710 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Samhd1Q60710 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Samhd1Q60710 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Samhd1Q60710 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Samhd1Q60710 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Samhd1Q60710 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Samhd1Q60710 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Samhd1Q60710 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Samhd1Q60710 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Samhd1Q60710 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Samhd1Q60710 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Samhd1Q60710 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Samhd1Q60710 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Samhd1Q60710 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Samhd1Q60710 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Samhd1Q60710 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Samhd1Q60710 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Samhd1Q60710 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Samhd1Q60710 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Samhd1Q60710 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Samhd1Q60710 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Samhd1Q60710 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Samhd1Q60710 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Samhd1Q60710 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Samhd1Q60710 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Samhd1Q60710 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Samhd1Q60710 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Samhd1Q60710 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Samhd1Q60710 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Samhd1Q60710 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Samhd1Q60710 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Samhd1Q60710 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Samhd1Q60710 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Samhd1Q60710 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Samhd1Q60710 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Samhd1Q60710 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Samhd1Q60710 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Samhd1Q60710 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Samhd1Q60710 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Samhd1Q60710 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Samhd1Q60710 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Samhd1Q60710 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Samhd1Q60710 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Samhd1Q60710 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Samhd1Q60710 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Samhd1Q60710 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Samhd1Q60710 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Samhd1Q60710 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Samhd1Q60710 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Samhd1Q60710 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Samhd1Q60710 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Samhd1Q60710 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Samhd1Q60710 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Samhd1Q60710 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Samhd1Q60710 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Samhd1Q60710 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Samhd1Q60710 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Samhd1Q60710 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Samhd1Q60710 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Samhd1Q60710 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Samhd1Q60710 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Samhd1Q60710 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Samhd1Q60710 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Samhd1Q60710 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Samhd1Q60710 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Samhd1Q60710 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Samhd1Q60710 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Samhd1Q60710 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Samhd1Q60710 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Samhd1Q60710 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Samhd1Q60710 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Samhd1Q60710 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Samhd1Q60710 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Samhd1Q60710 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Samhd1Q60710 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Samhd1Q60710 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Samhd1Q60710 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Samhd1Q60710 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Samhd1Q60710 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Samhd1Q60710 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Samhd1Q60710 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Samhd1Q60710 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Samhd1Q60710 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Samhd1Q60710 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Samhd1Q60710 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Samhd1Q60710 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Samhd1Q60710 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Samhd1Q60710 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Samhd1Q60710 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Samhd1Q60710 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Samhd1Q60710 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Samhd1Q60710 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Samhd1Q60710 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Samhd1Q60710 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Samhd1Q60710 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Samhd1Q60710 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Samhd1Q60710 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74 ms