Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSW2

Psme4, Proteasome activator complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme4Q5SSW2 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psme4Q5SSW2 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psme4Q5SSW2 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psme4Q5SSW2 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psme4Q5SSW2 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psme4Q5SSW2 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psme4Q5SSW2 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psme4Q5SSW2 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psme4Q5SSW2 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psme4Q5SSW2 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psme4Q5SSW2 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Psme4Q5SSW2 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Psme4Q5SSW2 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Psme4Q5SSW2 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psme4Q5SSW2 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psme4Q5SSW2 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Psme4Q5SSW2 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psme4Q5SSW2 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psme4Q5SSW2 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psme4Q5SSW2 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psme4Q5SSW2 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psme4Q5SSW2 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psme4Q5SSW2 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psme4Q5SSW2 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psme4Q5SSW2 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psme4Q5SSW2 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psme4Q5SSW2 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psme4Q5SSW2 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psme4Q5SSW2 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psme4Q5SSW2 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psme4Q5SSW2 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psme4Q5SSW2 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psme4Q5SSW2 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Psme4Q5SSW2 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psme4Q5SSW2 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psme4Q5SSW2 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Psme4Q5SSW2 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psme4Q5SSW2 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psme4Q5SSW2 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psme4Q5SSW2 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psme4Q5SSW2 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psme4Q5SSW2 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psme4Q5SSW2 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psme4Q5SSW2 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psme4Q5SSW2 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psme4Q5SSW2 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psme4Q5SSW2 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psme4Q5SSW2 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psme4Q5SSW2 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psme4Q5SSW2 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psme4Q5SSW2 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psme4Q5SSW2 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psme4Q5SSW2 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psme4Q5SSW2 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Psme4Q5SSW2 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psme4Q5SSW2 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Psme4Q5SSW2 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Psme4Q5SSW2 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psme4Q5SSW2 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psme4Q5SSW2 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psme4Q5SSW2 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psme4Q5SSW2 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psme4Q5SSW2 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Psme4Q5SSW2 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psme4Q5SSW2 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psme4Q5SSW2 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psme4Q5SSW2 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psme4Q5SSW2 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psme4Q5SSW2 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psme4Q5SSW2 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psme4Q5SSW2 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Psme4Q5SSW2 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psme4Q5SSW2 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psme4Q5SSW2 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Psme4Q5SSW2 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psme4Q5SSW2 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psme4Q5SSW2 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psme4Q5SSW2 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psme4Q5SSW2 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psme4Q5SSW2 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psme4Q5SSW2 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psme4Q5SSW2 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Psme4Q5SSW2 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psme4Q5SSW2 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psme4Q5SSW2 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psme4Q5SSW2 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Psme4Q5SSW2 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psme4Q5SSW2 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psme4Q5SSW2 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psme4Q5SSW2 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psme4Q5SSW2 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psme4Q5SSW2 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psme4Q5SSW2 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psme4Q5SSW2 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psme4Q5SSW2 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psme4Q5SSW2 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psme4Q5SSW2 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psme4Q5SSW2 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psme4Q5SSW2 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psme4Q5SSW2 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms