Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms