Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSI6

Utp18, U3 small nucleolar RNA-associated protein 18 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp18Q5SSI6 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Utp18Q5SSI6 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Utp18Q5SSI6 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Utp18Q5SSI6 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Utp18Q5SSI6 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Utp18Q5SSI6 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Utp18Q5SSI6 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Utp18Q5SSI6 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Utp18Q5SSI6 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Utp18Q5SSI6 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Utp18Q5SSI6 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Utp18Q5SSI6 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Utp18Q5SSI6 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Utp18Q5SSI6 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Utp18Q5SSI6 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Utp18Q5SSI6 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Utp18Q5SSI6 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Utp18Q5SSI6 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Utp18Q5SSI6 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Utp18Q5SSI6 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Utp18Q5SSI6 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Utp18Q5SSI6 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Utp18Q5SSI6 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Utp18Q5SSI6 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Utp18Q5SSI6 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Utp18Q5SSI6 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Utp18Q5SSI6 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Utp18Q5SSI6 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Utp18Q5SSI6 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Utp18Q5SSI6 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Utp18Q5SSI6 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Utp18Q5SSI6 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Utp18Q5SSI6 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Utp18Q5SSI6 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Utp18Q5SSI6 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Utp18Q5SSI6 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Utp18Q5SSI6 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Utp18Q5SSI6 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Utp18Q5SSI6 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Utp18Q5SSI6 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Utp18Q5SSI6 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Utp18Q5SSI6 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Utp18Q5SSI6 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Utp18Q5SSI6 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Utp18Q5SSI6 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Utp18Q5SSI6 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Utp18Q5SSI6 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Utp18Q5SSI6 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Utp18Q5SSI6 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Utp18Q5SSI6 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Utp18Q5SSI6 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Utp18Q5SSI6 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Utp18Q5SSI6 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Utp18Q5SSI6 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Utp18Q5SSI6 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Utp18Q5SSI6 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Utp18Q5SSI6 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Utp18Q5SSI6 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Utp18Q5SSI6 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Utp18Q5SSI6 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Utp18Q5SSI6 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Utp18Q5SSI6 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Utp18Q5SSI6 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Utp18Q5SSI6 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Utp18Q5SSI6 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Utp18Q5SSI6 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Utp18Q5SSI6 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Utp18Q5SSI6 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Utp18Q5SSI6 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Utp18Q5SSI6 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Utp18Q5SSI6 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Utp18Q5SSI6 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Utp18Q5SSI6 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Utp18Q5SSI6 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Utp18Q5SSI6 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Utp18Q5SSI6 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Utp18Q5SSI6 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Utp18Q5SSI6 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Utp18Q5SSI6 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Utp18Q5SSI6 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Utp18Q5SSI6 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Utp18Q5SSI6 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Utp18Q5SSI6 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Utp18Q5SSI6 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Utp18Q5SSI6 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Utp18Q5SSI6 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Utp18Q5SSI6 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Utp18Q5SSI6 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Utp18Q5SSI6 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Utp18Q5SSI6 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Utp18Q5SSI6 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Utp18Q5SSI6 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Utp18Q5SSI6 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Utp18Q5SSI6 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Utp18Q5SSI6 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Utp18Q5SSI6 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Utp18Q5SSI6 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Utp18Q5SSI6 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Utp18Q5SSI6 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Utp18Q5SSI6 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms