Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL14

Trappc3l, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3lQ4KL14 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc3lQ4KL14 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc3lQ4KL14 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc3lQ4KL14 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc3lQ4KL14 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc3lQ4KL14 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc3lQ4KL14 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc3lQ4KL14 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc3lQ4KL14 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc3lQ4KL14 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc3lQ4KL14 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc3lQ4KL14 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Trappc3lQ4KL14 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc3lQ4KL14 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc3lQ4KL14 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc3lQ4KL14 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc3lQ4KL14 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc3lQ4KL14 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc3lQ4KL14 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc3lQ4KL14 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Trappc3lQ4KL14 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc3lQ4KL14 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc3lQ4KL14 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc3lQ4KL14 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc3lQ4KL14 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc3lQ4KL14 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc3lQ4KL14 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc3lQ4KL14 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc3lQ4KL14 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc3lQ4KL14 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Trappc3lQ4KL14 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc3lQ4KL14 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Trappc3lQ4KL14 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc3lQ4KL14 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc3lQ4KL14 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc3lQ4KL14 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc3lQ4KL14 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc3lQ4KL14 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Trappc3lQ4KL14 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc3lQ4KL14 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc3lQ4KL14 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc3lQ4KL14 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc3lQ4KL14 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc3lQ4KL14 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Trappc3lQ4KL14 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Trappc3lQ4KL14 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc3lQ4KL14 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc3lQ4KL14 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc3lQ4KL14 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc3lQ4KL14 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc3lQ4KL14 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc3lQ4KL14 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc3lQ4KL14 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc3lQ4KL14 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc3lQ4KL14 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc3lQ4KL14 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc3lQ4KL14 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc3lQ4KL14 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc3lQ4KL14 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Trappc3lQ4KL14 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Trappc3lQ4KL14 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc3lQ4KL14 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Trappc3lQ4KL14 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc3lQ4KL14 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc3lQ4KL14 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc3lQ4KL14 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc3lQ4KL14 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc3lQ4KL14 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc3lQ4KL14 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc3lQ4KL14 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc3lQ4KL14 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc3lQ4KL14 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc3lQ4KL14 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc3lQ4KL14 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc3lQ4KL14 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc3lQ4KL14 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc3lQ4KL14 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc3lQ4KL14 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Trappc3lQ4KL14 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trappc3lQ4KL14 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trappc3lQ4KL14 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ 0
Trappc3lQ4KL14 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trappc3lQ4KL14 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trappc3lQ4KL14 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trappc3lQ4KL14 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trappc3lQ4KL14 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trappc3lQ4KL14 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Trappc3lQ4KL14 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trappc3lQ4KL14 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Trappc3lQ4KL14 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Trappc3lQ4KL14 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Trappc3lQ4KL14 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Trappc3lQ4KL14 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Trappc3lQ4KL14 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Trappc3lQ4KL14 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Trappc3lQ4KL14 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trappc3lQ4KL14 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Trappc3lQ4KL14 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trappc3lQ4KL14 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Trappc3lQ4KL14 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms