Protein–RNA interactions for Protein: Q4ACU6

Shank3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shank3Q4ACU6 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Shank3Q4ACU6 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Shank3Q4ACU6 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Shank3Q4ACU6 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Shank3Q4ACU6 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Shank3Q4ACU6 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Shank3Q4ACU6 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Shank3Q4ACU6 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Shank3Q4ACU6 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Shank3Q4ACU6 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Shank3Q4ACU6 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Shank3Q4ACU6 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Shank3Q4ACU6 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Shank3Q4ACU6 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Shank3Q4ACU6 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Shank3Q4ACU6 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Shank3Q4ACU6 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Shank3Q4ACU6 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Shank3Q4ACU6 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Shank3Q4ACU6 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Shank3Q4ACU6 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Shank3Q4ACU6 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Shank3Q4ACU6 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Shank3Q4ACU6 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Shank3Q4ACU6 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Shank3Q4ACU6 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Shank3Q4ACU6 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Shank3Q4ACU6 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Shank3Q4ACU6 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Shank3Q4ACU6 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Shank3Q4ACU6 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Shank3Q4ACU6 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Shank3Q4ACU6 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Shank3Q4ACU6 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Shank3Q4ACU6 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Shank3Q4ACU6 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Shank3Q4ACU6 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Shank3Q4ACU6 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Shank3Q4ACU6 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Shank3Q4ACU6 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Shank3Q4ACU6 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Shank3Q4ACU6 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Shank3Q4ACU6 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Shank3Q4ACU6 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Shank3Q4ACU6 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Shank3Q4ACU6 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Shank3Q4ACU6 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Shank3Q4ACU6 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Shank3Q4ACU6 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Shank3Q4ACU6 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Shank3Q4ACU6 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Shank3Q4ACU6 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Shank3Q4ACU6 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Shank3Q4ACU6 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Shank3Q4ACU6 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Shank3Q4ACU6 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Shank3Q4ACU6 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Shank3Q4ACU6 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Shank3Q4ACU6 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Shank3Q4ACU6 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Shank3Q4ACU6 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Shank3Q4ACU6 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Shank3Q4ACU6 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Shank3Q4ACU6 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Shank3Q4ACU6 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Shank3Q4ACU6 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Shank3Q4ACU6 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Shank3Q4ACU6 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Shank3Q4ACU6 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Shank3Q4ACU6 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Shank3Q4ACU6 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Shank3Q4ACU6 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Shank3Q4ACU6 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Shank3Q4ACU6 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Shank3Q4ACU6 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Shank3Q4ACU6 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Shank3Q4ACU6 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Shank3Q4ACU6 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Shank3Q4ACU6 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Shank3Q4ACU6 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Shank3Q4ACU6 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Shank3Q4ACU6 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Shank3Q4ACU6 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Shank3Q4ACU6 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Shank3Q4ACU6 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Shank3Q4ACU6 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Shank3Q4ACU6 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Shank3Q4ACU6 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Shank3Q4ACU6 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Shank3Q4ACU6 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Shank3Q4ACU6 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Shank3Q4ACU6 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Shank3Q4ACU6 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Shank3Q4ACU6 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Shank3Q4ACU6 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Shank3Q4ACU6 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Shank3Q4ACU6 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Shank3Q4ACU6 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Shank3Q4ACU6 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Shank3Q4ACU6 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms