Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1V3

Esf1, ESF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 845 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Esf1Q3V1V3 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Esf1Q3V1V3 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Esf1Q3V1V3 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Esf1Q3V1V3 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Esf1Q3V1V3 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Esf1Q3V1V3 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Esf1Q3V1V3 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Esf1Q3V1V3 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Esf1Q3V1V3 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Esf1Q3V1V3 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Esf1Q3V1V3 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Esf1Q3V1V3 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Esf1Q3V1V3 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Esf1Q3V1V3 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Esf1Q3V1V3 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Esf1Q3V1V3 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Esf1Q3V1V3 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Esf1Q3V1V3 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Esf1Q3V1V3 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Esf1Q3V1V3 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Esf1Q3V1V3 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Esf1Q3V1V3 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Esf1Q3V1V3 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Esf1Q3V1V3 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Esf1Q3V1V3 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Esf1Q3V1V3 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Esf1Q3V1V3 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Esf1Q3V1V3 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Esf1Q3V1V3 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Esf1Q3V1V3 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Esf1Q3V1V3 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Esf1Q3V1V3 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Esf1Q3V1V3 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Esf1Q3V1V3 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Esf1Q3V1V3 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Esf1Q3V1V3 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Esf1Q3V1V3 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Esf1Q3V1V3 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Esf1Q3V1V3 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Esf1Q3V1V3 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Esf1Q3V1V3 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Esf1Q3V1V3 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Esf1Q3V1V3 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Esf1Q3V1V3 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Esf1Q3V1V3 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Esf1Q3V1V3 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Esf1Q3V1V3 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Esf1Q3V1V3 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Esf1Q3V1V3 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Esf1Q3V1V3 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Esf1Q3V1V3 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Esf1Q3V1V3 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Esf1Q3V1V3 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Esf1Q3V1V3 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Esf1Q3V1V3 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Esf1Q3V1V3 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Esf1Q3V1V3 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Esf1Q3V1V3 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Esf1Q3V1V3 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Esf1Q3V1V3 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Esf1Q3V1V3 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Esf1Q3V1V3 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Esf1Q3V1V3 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Esf1Q3V1V3 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Esf1Q3V1V3 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Esf1Q3V1V3 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Esf1Q3V1V3 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Esf1Q3V1V3 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Esf1Q3V1V3 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Esf1Q3V1V3 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Esf1Q3V1V3 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Esf1Q3V1V3 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Esf1Q3V1V3 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Esf1Q3V1V3 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Esf1Q3V1V3 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Esf1Q3V1V3 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Esf1Q3V1V3 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Esf1Q3V1V3 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Esf1Q3V1V3 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Esf1Q3V1V3 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Esf1Q3V1V3 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Esf1Q3V1V3 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Esf1Q3V1V3 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Esf1Q3V1V3 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Esf1Q3V1V3 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Esf1Q3V1V3 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Esf1Q3V1V3 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Esf1Q3V1V3 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Esf1Q3V1V3 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Esf1Q3V1V3 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Esf1Q3V1V3 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Esf1Q3V1V3 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Esf1Q3V1V3 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Esf1Q3V1V3 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Esf1Q3V1V3 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Esf1Q3V1V3 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Esf1Q3V1V3 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Esf1Q3V1V3 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Esf1Q3V1V3 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Esf1Q3V1V3 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms