Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1H1

Ckap2, Cytoskeleton-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2Q3V1H1 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ckap2Q3V1H1 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ckap2Q3V1H1 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ckap2Q3V1H1 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ckap2Q3V1H1 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ckap2Q3V1H1 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ckap2Q3V1H1 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ckap2Q3V1H1 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ckap2Q3V1H1 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ckap2Q3V1H1 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ckap2Q3V1H1 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ckap2Q3V1H1 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ckap2Q3V1H1 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ckap2Q3V1H1 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ckap2Q3V1H1 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ckap2Q3V1H1 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ckap2Q3V1H1 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ckap2Q3V1H1 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ckap2Q3V1H1 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ckap2Q3V1H1 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ckap2Q3V1H1 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ckap2Q3V1H1 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ckap2Q3V1H1 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ckap2Q3V1H1 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ckap2Q3V1H1 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ckap2Q3V1H1 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ckap2Q3V1H1 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ckap2Q3V1H1 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ckap2Q3V1H1 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ckap2Q3V1H1 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ckap2Q3V1H1 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ckap2Q3V1H1 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ckap2Q3V1H1 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ckap2Q3V1H1 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ckap2Q3V1H1 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ckap2Q3V1H1 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ckap2Q3V1H1 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ckap2Q3V1H1 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ckap2Q3V1H1 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ckap2Q3V1H1 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ckap2Q3V1H1 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ckap2Q3V1H1 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ckap2Q3V1H1 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ckap2Q3V1H1 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ckap2Q3V1H1 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ckap2Q3V1H1 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ckap2Q3V1H1 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ckap2Q3V1H1 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ckap2Q3V1H1 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ckap2Q3V1H1 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ckap2Q3V1H1 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ckap2Q3V1H1 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ckap2Q3V1H1 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ckap2Q3V1H1 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ckap2Q3V1H1 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ckap2Q3V1H1 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ckap2Q3V1H1 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ckap2Q3V1H1 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ckap2Q3V1H1 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ckap2Q3V1H1 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ckap2Q3V1H1 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ckap2Q3V1H1 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ckap2Q3V1H1 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ckap2Q3V1H1 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ckap2Q3V1H1 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ckap2Q3V1H1 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ckap2Q3V1H1 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ckap2Q3V1H1 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ckap2Q3V1H1 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ckap2Q3V1H1 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ckap2Q3V1H1 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ckap2Q3V1H1 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ckap2Q3V1H1 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ckap2Q3V1H1 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ckap2Q3V1H1 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ckap2Q3V1H1 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ckap2Q3V1H1 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ckap2Q3V1H1 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ckap2Q3V1H1 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ckap2Q3V1H1 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ckap2Q3V1H1 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ckap2Q3V1H1 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ckap2Q3V1H1 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ckap2Q3V1H1 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ckap2Q3V1H1 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ckap2Q3V1H1 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ckap2Q3V1H1 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ckap2Q3V1H1 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ckap2Q3V1H1 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ckap2Q3V1H1 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ckap2Q3V1H1 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ckap2Q3V1H1 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ckap2Q3V1H1 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ckap2Q3V1H1 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ckap2Q3V1H1 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ckap2Q3V1H1 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ckap2Q3V1H1 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ckap2Q3V1H1 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ckap2Q3V1H1 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ckap2Q3V1H1 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms