Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW13

D130052B06Rik, RIKEN cDNA D130052B06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D130052B06RikQ3UW13 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
D130052B06RikQ3UW13 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
D130052B06RikQ3UW13 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
D130052B06RikQ3UW13 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
D130052B06RikQ3UW13 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
D130052B06RikQ3UW13 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
D130052B06RikQ3UW13 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
D130052B06RikQ3UW13 Madd-206ENSMUST00000099725 5905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
D130052B06RikQ3UW13 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
D130052B06RikQ3UW13 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
D130052B06RikQ3UW13 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
D130052B06RikQ3UW13 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
D130052B06RikQ3UW13 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
D130052B06RikQ3UW13 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
D130052B06RikQ3UW13 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
D130052B06RikQ3UW13 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
D130052B06RikQ3UW13 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
D130052B06RikQ3UW13 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
D130052B06RikQ3UW13 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
D130052B06RikQ3UW13 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
D130052B06RikQ3UW13 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
D130052B06RikQ3UW13 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
D130052B06RikQ3UW13 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
D130052B06RikQ3UW13 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
D130052B06RikQ3UW13 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC9.35□□□□□ -0.91
D130052B06RikQ3UW13 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
D130052B06RikQ3UW13 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
D130052B06RikQ3UW13 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
D130052B06RikQ3UW13 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
D130052B06RikQ3UW13 Gm45191-201ENSMUST00000205846 5439 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
D130052B06RikQ3UW13 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
D130052B06RikQ3UW13 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
D130052B06RikQ3UW13 Xirp1-201ENSMUST00000111635 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
D130052B06RikQ3UW13 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
D130052B06RikQ3UW13 Vmn1r184-207ENSMUST00000228369 6361 ntAPPRIS P1 BASIC9.35□□□□□ -0.91
D130052B06RikQ3UW13 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
D130052B06RikQ3UW13 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
D130052B06RikQ3UW13 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
D130052B06RikQ3UW13 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
D130052B06RikQ3UW13 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
D130052B06RikQ3UW13 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
D130052B06RikQ3UW13 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
D130052B06RikQ3UW13 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
D130052B06RikQ3UW13 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
D130052B06RikQ3UW13 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
D130052B06RikQ3UW13 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
D130052B06RikQ3UW13 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
D130052B06RikQ3UW13 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
D130052B06RikQ3UW13 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
D130052B06RikQ3UW13 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
D130052B06RikQ3UW13 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
D130052B06RikQ3UW13 Rpgrip1-202ENSMUST00000111603 5380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
D130052B06RikQ3UW13 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
D130052B06RikQ3UW13 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
D130052B06RikQ3UW13 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
D130052B06RikQ3UW13 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
D130052B06RikQ3UW13 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
D130052B06RikQ3UW13 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
D130052B06RikQ3UW13 Kalrn-202ENSMUST00000089655 6506 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
D130052B06RikQ3UW13 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
D130052B06RikQ3UW13 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
D130052B06RikQ3UW13 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
D130052B06RikQ3UW13 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
D130052B06RikQ3UW13 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
D130052B06RikQ3UW13 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.91
D130052B06RikQ3UW13 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
D130052B06RikQ3UW13 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
D130052B06RikQ3UW13 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
D130052B06RikQ3UW13 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.91
D130052B06RikQ3UW13 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.91
D130052B06RikQ3UW13 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
D130052B06RikQ3UW13 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
D130052B06RikQ3UW13 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
D130052B06RikQ3UW13 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
D130052B06RikQ3UW13 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
D130052B06RikQ3UW13 Crocc2-201ENSMUST00000138595 7132 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
D130052B06RikQ3UW13 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
D130052B06RikQ3UW13 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
D130052B06RikQ3UW13 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
D130052B06RikQ3UW13 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
D130052B06RikQ3UW13 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
D130052B06RikQ3UW13 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
D130052B06RikQ3UW13 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
D130052B06RikQ3UW13 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
D130052B06RikQ3UW13 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
D130052B06RikQ3UW13 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
D130052B06RikQ3UW13 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.92
D130052B06RikQ3UW13 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.92
D130052B06RikQ3UW13 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC9.33□□□□□ -0.92
D130052B06RikQ3UW13 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
D130052B06RikQ3UW13 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
D130052B06RikQ3UW13 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
D130052B06RikQ3UW13 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
D130052B06RikQ3UW13 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
D130052B06RikQ3UW13 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
D130052B06RikQ3UW13 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
D130052B06RikQ3UW13 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
D130052B06RikQ3UW13 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
D130052B06RikQ3UW13 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
D130052B06RikQ3UW13 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms