Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm28047Q3US59 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm28047Q3US59 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm28047Q3US59 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm28047Q3US59 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm28047Q3US59 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm28047Q3US59 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm28047Q3US59 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm28047Q3US59 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm28047Q3US59 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm28047Q3US59 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm28047Q3US59 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm28047Q3US59 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm28047Q3US59 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm28047Q3US59 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm28047Q3US59 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms