Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Znf48Q3US17 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Znf48Q3US17 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Znf48Q3US17 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Znf48Q3US17 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Znf48Q3US17 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Znf48Q3US17 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Znf48Q3US17 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Znf48Q3US17 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Znf48Q3US17 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Znf48Q3US17 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Znf48Q3US17 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Znf48Q3US17 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Znf48Q3US17 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Znf48Q3US17 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Znf48Q3US17 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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Znf48Q3US17 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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Znf48Q3US17 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Znf48Q3US17 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Znf48Q3US17 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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Znf48Q3US17 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Znf48Q3US17 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
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Znf48Q3US17 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Znf48Q3US17 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Znf48Q3US17 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Znf48Q3US17 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Znf48Q3US17 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Znf48Q3US17 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Znf48Q3US17 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Znf48Q3US17 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Znf48Q3US17 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Znf48Q3US17 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Znf48Q3US17 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Znf48Q3US17 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Znf48Q3US17 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Znf48Q3US17 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Znf48Q3US17 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Znf48Q3US17 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Znf48Q3US17 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Znf48Q3US17 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Znf48Q3US17 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
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