Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.33□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC9.33□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.33□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms