Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPC7

Uncharacterized protein KIAA0825 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3UPC7 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q3UPC7 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q3UPC7 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q3UPC7 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q3UPC7 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q3UPC7 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q3UPC7 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q3UPC7 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q3UPC7 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q3UPC7 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q3UPC7 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Q3UPC7 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q3UPC7 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q3UPC7 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q3UPC7 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Q3UPC7 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q3UPC7 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q3UPC7 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Q3UPC7 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Q3UPC7 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q3UPC7 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q3UPC7 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q3UPC7 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q3UPC7 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q3UPC7 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q3UPC7 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q3UPC7 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q3UPC7 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q3UPC7 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q3UPC7 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q3UPC7 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q3UPC7 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q3UPC7 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Q3UPC7 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Q3UPC7 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Q3UPC7 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Q3UPC7 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Q3UPC7 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Q3UPC7 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Q3UPC7 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Q3UPC7 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q3UPC7 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q3UPC7 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q3UPC7 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q3UPC7 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q3UPC7 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q3UPC7 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q3UPC7 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q3UPC7 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Q3UPC7 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Q3UPC7 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q3UPC7 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Q3UPC7 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q3UPC7 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q3UPC7 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q3UPC7 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q3UPC7 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q3UPC7 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q3UPC7 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Q3UPC7 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q3UPC7 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q3UPC7 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q3UPC7 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q3UPC7 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q3UPC7 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q3UPC7 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q3UPC7 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q3UPC7 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q3UPC7 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q3UPC7 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q3UPC7 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q3UPC7 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Q3UPC7 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q3UPC7 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q3UPC7 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q3UPC7 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q3UPC7 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q3UPC7 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q3UPC7 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q3UPC7 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q3UPC7 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q3UPC7 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q3UPC7 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q3UPC7 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q3UPC7 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q3UPC7 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q3UPC7 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q3UPC7 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q3UPC7 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q3UPC7 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q3UPC7 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q3UPC7 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q3UPC7 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q3UPC7 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q3UPC7 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q3UPC7 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Q3UPC7 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q3UPC7 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q3UPC7 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q3UPC7 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms