Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

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Length 204 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmem253Q3UNB8 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmem253Q3UNB8 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmem253Q3UNB8 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmem253Q3UNB8 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmem253Q3UNB8 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmem253Q3UNB8 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmem253Q3UNB8 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmem253Q3UNB8 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmem253Q3UNB8 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmem253Q3UNB8 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmem253Q3UNB8 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmem253Q3UNB8 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmem253Q3UNB8 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmem253Q3UNB8 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmem253Q3UNB8 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmem253Q3UNB8 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmem253Q3UNB8 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmem253Q3UNB8 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmem253Q3UNB8 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmem253Q3UNB8 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmem253Q3UNB8 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmem253Q3UNB8 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmem253Q3UNB8 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmem253Q3UNB8 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmem253Q3UNB8 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmem253Q3UNB8 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmem253Q3UNB8 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmem253Q3UNB8 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmem253Q3UNB8 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmem253Q3UNB8 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmem253Q3UNB8 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmem253Q3UNB8 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmem253Q3UNB8 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmem253Q3UNB8 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmem253Q3UNB8 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmem253Q3UNB8 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmem253Q3UNB8 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmem253Q3UNB8 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmem253Q3UNB8 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmem253Q3UNB8 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmem253Q3UNB8 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmem253Q3UNB8 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmem253Q3UNB8 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmem253Q3UNB8 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmem253Q3UNB8 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmem253Q3UNB8 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmem253Q3UNB8 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmem253Q3UNB8 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmem253Q3UNB8 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmem253Q3UNB8 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmem253Q3UNB8 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmem253Q3UNB8 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmem253Q3UNB8 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmem253Q3UNB8 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmem253Q3UNB8 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmem253Q3UNB8 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmem253Q3UNB8 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmem253Q3UNB8 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmem253Q3UNB8 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmem253Q3UNB8 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmem253Q3UNB8 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmem253Q3UNB8 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmem253Q3UNB8 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmem253Q3UNB8 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmem253Q3UNB8 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmem253Q3UNB8 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmem253Q3UNB8 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmem253Q3UNB8 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmem253Q3UNB8 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmem253Q3UNB8 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmem253Q3UNB8 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmem253Q3UNB8 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmem253Q3UNB8 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmem253Q3UNB8 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmem253Q3UNB8 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmem253Q3UNB8 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmem253Q3UNB8 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmem253Q3UNB8 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmem253Q3UNB8 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmem253Q3UNB8 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmem253Q3UNB8 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmem253Q3UNB8 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmem253Q3UNB8 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmem253Q3UNB8 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmem253Q3UNB8 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmem253Q3UNB8 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmem253Q3UNB8 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmem253Q3UNB8 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmem253Q3UNB8 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmem253Q3UNB8 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmem253Q3UNB8 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmem253Q3UNB8 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmem253Q3UNB8 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmem253Q3UNB8 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmem253Q3UNB8 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmem253Q3UNB8 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmem253Q3UNB8 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmem253Q3UNB8 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmem253Q3UNB8 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
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