Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMR0

Ankrd27, Ankyrin repeat domain-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd27Q3UMR0 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ankrd27Q3UMR0 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ankrd27Q3UMR0 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ankrd27Q3UMR0 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ankrd27Q3UMR0 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ankrd27Q3UMR0 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ankrd27Q3UMR0 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ankrd27Q3UMR0 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ankrd27Q3UMR0 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ankrd27Q3UMR0 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ankrd27Q3UMR0 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ankrd27Q3UMR0 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ankrd27Q3UMR0 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ankrd27Q3UMR0 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ankrd27Q3UMR0 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ankrd27Q3UMR0 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ankrd27Q3UMR0 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ankrd27Q3UMR0 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ankrd27Q3UMR0 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ankrd27Q3UMR0 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ankrd27Q3UMR0 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ankrd27Q3UMR0 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ankrd27Q3UMR0 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ankrd27Q3UMR0 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ankrd27Q3UMR0 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ankrd27Q3UMR0 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ankrd27Q3UMR0 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ankrd27Q3UMR0 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ankrd27Q3UMR0 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ankrd27Q3UMR0 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ankrd27Q3UMR0 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ankrd27Q3UMR0 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ankrd27Q3UMR0 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ankrd27Q3UMR0 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ankrd27Q3UMR0 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ankrd27Q3UMR0 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ankrd27Q3UMR0 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ankrd27Q3UMR0 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Ankrd27Q3UMR0 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Ankrd27Q3UMR0 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ankrd27Q3UMR0 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Ankrd27Q3UMR0 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ankrd27Q3UMR0 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ankrd27Q3UMR0 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Ankrd27Q3UMR0 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ankrd27Q3UMR0 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ankrd27Q3UMR0 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ankrd27Q3UMR0 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ankrd27Q3UMR0 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ankrd27Q3UMR0 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ankrd27Q3UMR0 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ankrd27Q3UMR0 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ankrd27Q3UMR0 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ankrd27Q3UMR0 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ankrd27Q3UMR0 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ankrd27Q3UMR0 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ankrd27Q3UMR0 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ankrd27Q3UMR0 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ankrd27Q3UMR0 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ankrd27Q3UMR0 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ankrd27Q3UMR0 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ankrd27Q3UMR0 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ankrd27Q3UMR0 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ankrd27Q3UMR0 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ankrd27Q3UMR0 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ankrd27Q3UMR0 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ankrd27Q3UMR0 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ankrd27Q3UMR0 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ankrd27Q3UMR0 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ankrd27Q3UMR0 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ankrd27Q3UMR0 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ankrd27Q3UMR0 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ankrd27Q3UMR0 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ankrd27Q3UMR0 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ankrd27Q3UMR0 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ankrd27Q3UMR0 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ankrd27Q3UMR0 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Ankrd27Q3UMR0 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Ankrd27Q3UMR0 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ankrd27Q3UMR0 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Ankrd27Q3UMR0 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Ankrd27Q3UMR0 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ankrd27Q3UMR0 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Ankrd27Q3UMR0 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Ankrd27Q3UMR0 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ankrd27Q3UMR0 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ankrd27Q3UMR0 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ankrd27Q3UMR0 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ankrd27Q3UMR0 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ankrd27Q3UMR0 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ankrd27Q3UMR0 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ankrd27Q3UMR0 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ankrd27Q3UMR0 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ankrd27Q3UMR0 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ankrd27Q3UMR0 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ankrd27Q3UMR0 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ankrd27Q3UMR0 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ankrd27Q3UMR0 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ankrd27Q3UMR0 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ankrd27Q3UMR0 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.5 ms