Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW6

Ccdc33, Coiled-coil domain-containing protein 33, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc33Q3ULW6 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms