Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGP9

Lrrc58, Leucine-rich repeat-containing protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc58Q3UGP9 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lrrc58Q3UGP9 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lrrc58Q3UGP9 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lrrc58Q3UGP9 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lrrc58Q3UGP9 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lrrc58Q3UGP9 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lrrc58Q3UGP9 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lrrc58Q3UGP9 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lrrc58Q3UGP9 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lrrc58Q3UGP9 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lrrc58Q3UGP9 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lrrc58Q3UGP9 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lrrc58Q3UGP9 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lrrc58Q3UGP9 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lrrc58Q3UGP9 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lrrc58Q3UGP9 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lrrc58Q3UGP9 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lrrc58Q3UGP9 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lrrc58Q3UGP9 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lrrc58Q3UGP9 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lrrc58Q3UGP9 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lrrc58Q3UGP9 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lrrc58Q3UGP9 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lrrc58Q3UGP9 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lrrc58Q3UGP9 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lrrc58Q3UGP9 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lrrc58Q3UGP9 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Lrrc58Q3UGP9 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Lrrc58Q3UGP9 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lrrc58Q3UGP9 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Lrrc58Q3UGP9 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Lrrc58Q3UGP9 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lrrc58Q3UGP9 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lrrc58Q3UGP9 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lrrc58Q3UGP9 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lrrc58Q3UGP9 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lrrc58Q3UGP9 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lrrc58Q3UGP9 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lrrc58Q3UGP9 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lrrc58Q3UGP9 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Lrrc58Q3UGP9 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lrrc58Q3UGP9 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lrrc58Q3UGP9 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lrrc58Q3UGP9 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lrrc58Q3UGP9 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lrrc58Q3UGP9 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lrrc58Q3UGP9 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Lrrc58Q3UGP9 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Lrrc58Q3UGP9 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Lrrc58Q3UGP9 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Lrrc58Q3UGP9 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Lrrc58Q3UGP9 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lrrc58Q3UGP9 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lrrc58Q3UGP9 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lrrc58Q3UGP9 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lrrc58Q3UGP9 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lrrc58Q3UGP9 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lrrc58Q3UGP9 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lrrc58Q3UGP9 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lrrc58Q3UGP9 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lrrc58Q3UGP9 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lrrc58Q3UGP9 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lrrc58Q3UGP9 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lrrc58Q3UGP9 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lrrc58Q3UGP9 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lrrc58Q3UGP9 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lrrc58Q3UGP9 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lrrc58Q3UGP9 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lrrc58Q3UGP9 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lrrc58Q3UGP9 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lrrc58Q3UGP9 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Lrrc58Q3UGP9 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Lrrc58Q3UGP9 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lrrc58Q3UGP9 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lrrc58Q3UGP9 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lrrc58Q3UGP9 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lrrc58Q3UGP9 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lrrc58Q3UGP9 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lrrc58Q3UGP9 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lrrc58Q3UGP9 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lrrc58Q3UGP9 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lrrc58Q3UGP9 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lrrc58Q3UGP9 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lrrc58Q3UGP9 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lrrc58Q3UGP9 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lrrc58Q3UGP9 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lrrc58Q3UGP9 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lrrc58Q3UGP9 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lrrc58Q3UGP9 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lrrc58Q3UGP9 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lrrc58Q3UGP9 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lrrc58Q3UGP9 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lrrc58Q3UGP9 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lrrc58Q3UGP9 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lrrc58Q3UGP9 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lrrc58Q3UGP9 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lrrc58Q3UGP9 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lrrc58Q3UGP9 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lrrc58Q3UGP9 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lrrc58Q3UGP9 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms