Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gtpbp6Q3U6U5 Gm17177-202ENSMUST00000222007 990 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gtpbp6Q3U6U5 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr19-201ENSMUST00000057886 1142 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gtpbp6Q3U6U5 Lxn-201ENSMUST00000058981 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gtpbp6Q3U6U5 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gtpbp6Q3U6U5 Vmn1r132-201ENSMUST00000098736 894 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gtpbp6Q3U6U5 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gtpbp6Q3U6U5 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gtpbp6Q3U6U5 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gtpbp6Q3U6U5 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gtpbp6Q3U6U5 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gtpbp6Q3U6U5 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gtpbp6Q3U6U5 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gtpbp6Q3U6U5 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gtpbp6Q3U6U5 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gtpbp6Q3U6U5 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gtpbp6Q3U6U5 Gm20121-201ENSMUST00000198547 1594 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Gtpbp6Q3U6U5 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Gtpbp6Q3U6U5 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gtpbp6Q3U6U5 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gtpbp6Q3U6U5 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gtpbp6Q3U6U5 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gtpbp6Q3U6U5 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gtpbp6Q3U6U5 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gtpbp6Q3U6U5 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gtpbp6Q3U6U5 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr1118-201ENSMUST00000121296 996 ntAPPRIS P2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12670-201ENSMUST00000123606 576 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gtpbp6Q3U6U5 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gtpbp6Q3U6U5 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gtpbp6Q3U6U5 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28926-201ENSMUST00000191063 680 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Gtpbp6Q3U6U5 Gm37560-201ENSMUST00000194289 1000 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Gtpbp6Q3U6U5 Gm42591-201ENSMUST00000197249 700 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Gtpbp6Q3U6U5 Gm38509-201ENSMUST00000197492 1150 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gtpbp6Q3U6U5 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Gtpbp6Q3U6U5 AC153361.2-203ENSMUST00000218083 661 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gtpbp6Q3U6U5 AC132384.6-201ENSMUST00000218976 1206 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Gtpbp6Q3U6U5 AC134537.3-201ENSMUST00000220154 503 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gtpbp6Q3U6U5 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gtpbp6Q3U6U5 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gtpbp6Q3U6U5 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gtpbp6Q3U6U5 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gtpbp6Q3U6U5 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gtpbp6Q3U6U5 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gtpbp6Q3U6U5 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gtpbp6Q3U6U5 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gtpbp6Q3U6U5 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Gtpbp6Q3U6U5 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gtpbp6Q3U6U5 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gtpbp6Q3U6U5 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gtpbp6Q3U6U5 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gtpbp6Q3U6U5 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gtpbp6Q3U6U5 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gtpbp6Q3U6U5 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gtpbp6Q3U6U5 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gtpbp6Q3U6U5 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gtpbp6Q3U6U5 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gtpbp6Q3U6U5 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gtpbp6Q3U6U5 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gtpbp6Q3U6U5 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gtpbp6Q3U6U5 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gtpbp6Q3U6U5 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gtpbp6Q3U6U5 Gm14718-201ENSMUST00000138082 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gtpbp6Q3U6U5 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gtpbp6Q3U6U5 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gtpbp6Q3U6U5 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gtpbp6Q3U6U5 Gm6918-201ENSMUST00000167622 1222 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Gtpbp6Q3U6U5 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Gtpbp6Q3U6U5 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gtpbp6Q3U6U5 Gm33050-201ENSMUST00000198132 501 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gtpbp6Q3U6U5 1700051K13Rik-201ENSMUST00000204426 696 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Gtpbp6Q3U6U5 Gm21089-201ENSMUST00000215843 325 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Gtpbp6Q3U6U5 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gtpbp6Q3U6U5 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gtpbp6Q3U6U5 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gtpbp6Q3U6U5 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gtpbp6Q3U6U5 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gtpbp6Q3U6U5 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gtpbp6Q3U6U5 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gtpbp6Q3U6U5 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gtpbp6Q3U6U5 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gtpbp6Q3U6U5 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gtpbp6Q3U6U5 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gtpbp6Q3U6U5 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gtpbp6Q3U6U5 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Gtpbp6Q3U6U5 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gtpbp6Q3U6U5 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gtpbp6Q3U6U5 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gtpbp6Q3U6U5 Cenpk-202ENSMUST00000070761 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gtpbp6Q3U6U5 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gtpbp6Q3U6U5 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms