Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rnf149Q3U2C5 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rnf149Q3U2C5 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rnf149Q3U2C5 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rnf149Q3U2C5 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Rnf149Q3U2C5 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rnf149Q3U2C5 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Rnf149Q3U2C5 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rnf149Q3U2C5 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Rnf149Q3U2C5 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rnf149Q3U2C5 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rnf149Q3U2C5 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rnf149Q3U2C5 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rnf149Q3U2C5 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rnf149Q3U2C5 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rnf149Q3U2C5 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Rnf149Q3U2C5 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rnf149Q3U2C5 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rnf149Q3U2C5 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rnf149Q3U2C5 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rnf149Q3U2C5 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rnf149Q3U2C5 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Rnf149Q3U2C5 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rnf149Q3U2C5 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rnf149Q3U2C5 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rnf149Q3U2C5 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rnf149Q3U2C5 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Rnf149Q3U2C5 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Rnf149Q3U2C5 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rnf149Q3U2C5 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Rnf149Q3U2C5 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rnf149Q3U2C5 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rnf149Q3U2C5 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rnf149Q3U2C5 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Rnf149Q3U2C5 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Rnf149Q3U2C5 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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Rnf149Q3U2C5 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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Rnf149Q3U2C5 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnf149Q3U2C5 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
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Rnf149Q3U2C5 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnf149Q3U2C5 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnf149Q3U2C5 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnf149Q3U2C5 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnf149Q3U2C5 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnf149Q3U2C5 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnf149Q3U2C5 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnf149Q3U2C5 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnf149Q3U2C5 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnf149Q3U2C5 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnf149Q3U2C5 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnf149Q3U2C5 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnf149Q3U2C5 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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Rnf149Q3U2C5 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnf149Q3U2C5 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnf149Q3U2C5 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnf149Q3U2C5 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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