Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0P1

Palb2, Partner and localizer of BRCA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palb2Q3U0P1 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms