Protein–RNA interactions for Protein: Q3TUH1

Tamm41, Phosphatidate cytidylyltransferase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tamm41Q3TUH1 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tamm41Q3TUH1 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tamm41Q3TUH1 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tamm41Q3TUH1 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tamm41Q3TUH1 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tamm41Q3TUH1 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tamm41Q3TUH1 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tamm41Q3TUH1 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tamm41Q3TUH1 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tamm41Q3TUH1 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tamm41Q3TUH1 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tamm41Q3TUH1 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tamm41Q3TUH1 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tamm41Q3TUH1 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tamm41Q3TUH1 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tamm41Q3TUH1 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Tamm41Q3TUH1 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tamm41Q3TUH1 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tamm41Q3TUH1 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tamm41Q3TUH1 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tamm41Q3TUH1 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Tamm41Q3TUH1 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tamm41Q3TUH1 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tamm41Q3TUH1 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Tamm41Q3TUH1 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Tamm41Q3TUH1 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tamm41Q3TUH1 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tamm41Q3TUH1 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tamm41Q3TUH1 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tamm41Q3TUH1 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tamm41Q3TUH1 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tamm41Q3TUH1 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tamm41Q3TUH1 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tamm41Q3TUH1 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Tamm41Q3TUH1 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tamm41Q3TUH1 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tamm41Q3TUH1 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tamm41Q3TUH1 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tamm41Q3TUH1 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tamm41Q3TUH1 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tamm41Q3TUH1 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tamm41Q3TUH1 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tamm41Q3TUH1 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tamm41Q3TUH1 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tamm41Q3TUH1 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tamm41Q3TUH1 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tamm41Q3TUH1 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tamm41Q3TUH1 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tamm41Q3TUH1 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tamm41Q3TUH1 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tamm41Q3TUH1 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tamm41Q3TUH1 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tamm41Q3TUH1 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tamm41Q3TUH1 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tamm41Q3TUH1 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tamm41Q3TUH1 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tamm41Q3TUH1 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tamm41Q3TUH1 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tamm41Q3TUH1 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tamm41Q3TUH1 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tamm41Q3TUH1 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tamm41Q3TUH1 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tamm41Q3TUH1 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tamm41Q3TUH1 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tamm41Q3TUH1 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tamm41Q3TUH1 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tamm41Q3TUH1 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tamm41Q3TUH1 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Tamm41Q3TUH1 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tamm41Q3TUH1 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tamm41Q3TUH1 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tamm41Q3TUH1 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tamm41Q3TUH1 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tamm41Q3TUH1 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tamm41Q3TUH1 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tamm41Q3TUH1 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tamm41Q3TUH1 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Tamm41Q3TUH1 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Tamm41Q3TUH1 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Tamm41Q3TUH1 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Tamm41Q3TUH1 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Tamm41Q3TUH1 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Tamm41Q3TUH1 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Tamm41Q3TUH1 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Tamm41Q3TUH1 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Tamm41Q3TUH1 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Tamm41Q3TUH1 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Tamm41Q3TUH1 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Tamm41Q3TUH1 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Tamm41Q3TUH1 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tamm41Q3TUH1 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tamm41Q3TUH1 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tamm41Q3TUH1 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tamm41Q3TUH1 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tamm41Q3TUH1 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tamm41Q3TUH1 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tamm41Q3TUH1 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tamm41Q3TUH1 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tamm41Q3TUH1 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tamm41Q3TUH1 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms