Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf3c3Q3TMP1 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtf3c3Q3TMP1 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtf3c3Q3TMP1 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtf3c3Q3TMP1 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtf3c3Q3TMP1 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms