Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Cpne9Q1RLL3 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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