Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Trim71Q1PSW8 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Trim71Q1PSW8 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Trim71Q1PSW8 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Trim71Q1PSW8 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Trim71Q1PSW8 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Trim71Q1PSW8 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Trim71Q1PSW8 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Trim71Q1PSW8 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Trim71Q1PSW8 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Trim71Q1PSW8 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Trim71Q1PSW8 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Trim71Q1PSW8 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Trim71Q1PSW8 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Trim71Q1PSW8 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Trim71Q1PSW8 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Trim71Q1PSW8 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Trim71Q1PSW8 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Trim71Q1PSW8 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Trim71Q1PSW8 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Trim71Q1PSW8 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Trim71Q1PSW8 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Trim71Q1PSW8 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Trim71Q1PSW8 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Trim71Q1PSW8 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Trim71Q1PSW8 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Trim71Q1PSW8 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Trim71Q1PSW8 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Trim71Q1PSW8 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Trim71Q1PSW8 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Trim71Q1PSW8 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Trim71Q1PSW8 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Trim71Q1PSW8 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Trim71Q1PSW8 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Trim71Q1PSW8 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Trim71Q1PSW8 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Trim71Q1PSW8 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Trim71Q1PSW8 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Trim71Q1PSW8 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Trim71Q1PSW8 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Trim71Q1PSW8 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Trim71Q1PSW8 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Trim71Q1PSW8 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Trim71Q1PSW8 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Trim71Q1PSW8 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Trim71Q1PSW8 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Trim71Q1PSW8 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Trim71Q1PSW8 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Trim71Q1PSW8 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Trim71Q1PSW8 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Trim71Q1PSW8 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Trim71Q1PSW8 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Trim71Q1PSW8 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Trim71Q1PSW8 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Trim71Q1PSW8 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Trim71Q1PSW8 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Trim71Q1PSW8 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Trim71Q1PSW8 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Trim71Q1PSW8 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Trim71Q1PSW8 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Trim71Q1PSW8 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Trim71Q1PSW8 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Trim71Q1PSW8 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Trim71Q1PSW8 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Trim71Q1PSW8 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Trim71Q1PSW8 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Trim71Q1PSW8 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Trim71Q1PSW8 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Trim71Q1PSW8 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Trim71Q1PSW8 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Trim71Q1PSW8 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Trim71Q1PSW8 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Trim71Q1PSW8 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Trim71Q1PSW8 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Trim71Q1PSW8 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Trim71Q1PSW8 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Trim71Q1PSW8 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Trim71Q1PSW8 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Trim71Q1PSW8 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Trim71Q1PSW8 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Trim71Q1PSW8 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Trim71Q1PSW8 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Trim71Q1PSW8 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Trim71Q1PSW8 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Trim71Q1PSW8 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Trim71Q1PSW8 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Trim71Q1PSW8 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Trim71Q1PSW8 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Trim71Q1PSW8 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Trim71Q1PSW8 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Trim71Q1PSW8 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Trim71Q1PSW8 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Trim71Q1PSW8 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Trim71Q1PSW8 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Trim71Q1PSW8 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Trim71Q1PSW8 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Trim71Q1PSW8 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Trim71Q1PSW8 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Trim71Q1PSW8 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Trim71Q1PSW8 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
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