Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ptchd1Q14B62 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ptchd1Q14B62 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ptchd1Q14B62 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ptchd1Q14B62 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ptchd1Q14B62 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ptchd1Q14B62 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ptchd1Q14B62 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ptchd1Q14B62 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ptchd1Q14B62 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ptchd1Q14B62 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ptchd1Q14B62 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ptchd1Q14B62 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ptchd1Q14B62 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ptchd1Q14B62 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ptchd1Q14B62 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ptchd1Q14B62 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ptchd1Q14B62 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ptchd1Q14B62 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ptchd1Q14B62 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ptchd1Q14B62 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ptchd1Q14B62 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ptchd1Q14B62 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ptchd1Q14B62 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ptchd1Q14B62 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ptchd1Q14B62 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
ptchd1Q14B62 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ptchd1Q14B62 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
ptchd1Q14B62 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ptchd1Q14B62 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
ptchd1Q14B62 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ptchd1Q14B62 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ptchd1Q14B62 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ptchd1Q14B62 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ptchd1Q14B62 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ptchd1Q14B62 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ptchd1Q14B62 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ptchd1Q14B62 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ptchd1Q14B62 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ptchd1Q14B62 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ptchd1Q14B62 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ptchd1Q14B62 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ptchd1Q14B62 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ptchd1Q14B62 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ptchd1Q14B62 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ptchd1Q14B62 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ptchd1Q14B62 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ptchd1Q14B62 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ptchd1Q14B62 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
ptchd1Q14B62 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ptchd1Q14B62 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ptchd1Q14B62 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ptchd1Q14B62 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ptchd1Q14B62 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ptchd1Q14B62 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ptchd1Q14B62 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ptchd1Q14B62 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
ptchd1Q14B62 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
ptchd1Q14B62 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
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ptchd1Q14B62 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ptchd1Q14B62 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
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ptchd1Q14B62 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ptchd1Q14B62 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ptchd1Q14B62 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ptchd1Q14B62 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ptchd1Q14B62 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
ptchd1Q14B62 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
ptchd1Q14B62 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ptchd1Q14B62 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ptchd1Q14B62 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ptchd1Q14B62 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ptchd1Q14B62 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ptchd1Q14B62 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
ptchd1Q14B62 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ptchd1Q14B62 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
ptchd1Q14B62 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
ptchd1Q14B62 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ptchd1Q14B62 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ptchd1Q14B62 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ptchd1Q14B62 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ptchd1Q14B62 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ptchd1Q14B62 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ptchd1Q14B62 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
ptchd1Q14B62 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
ptchd1Q14B62 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ptchd1Q14B62 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ptchd1Q14B62 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ptchd1Q14B62 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ptchd1Q14B62 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ptchd1Q14B62 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
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