Protein–RNA interactions for Protein: Q149B8

Perm1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 807 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Perm1Q149B8 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms