Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rundc1Q0VDN7 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rundc1Q0VDN7 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rundc1Q0VDN7 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rundc1Q0VDN7 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Rundc1Q0VDN7 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Rundc1Q0VDN7 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rundc1Q0VDN7 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rundc1Q0VDN7 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rundc1Q0VDN7 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rundc1Q0VDN7 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rundc1Q0VDN7 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rundc1Q0VDN7 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rundc1Q0VDN7 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Rundc1Q0VDN7 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rundc1Q0VDN7 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rundc1Q0VDN7 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rundc1Q0VDN7 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rundc1Q0VDN7 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rundc1Q0VDN7 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rundc1Q0VDN7 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rundc1Q0VDN7 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rundc1Q0VDN7 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rundc1Q0VDN7 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rundc1Q0VDN7 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rundc1Q0VDN7 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rundc1Q0VDN7 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rundc1Q0VDN7 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rundc1Q0VDN7 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rundc1Q0VDN7 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rundc1Q0VDN7 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rundc1Q0VDN7 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rundc1Q0VDN7 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Rundc1Q0VDN7 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Rundc1Q0VDN7 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rundc1Q0VDN7 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Rundc1Q0VDN7 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rundc1Q0VDN7 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rundc1Q0VDN7 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rundc1Q0VDN7 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rundc1Q0VDN7 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rundc1Q0VDN7 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rundc1Q0VDN7 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rundc1Q0VDN7 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rundc1Q0VDN7 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rundc1Q0VDN7 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rundc1Q0VDN7 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rundc1Q0VDN7 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rundc1Q0VDN7 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rundc1Q0VDN7 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rundc1Q0VDN7 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Rundc1Q0VDN7 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rundc1Q0VDN7 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rundc1Q0VDN7 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rundc1Q0VDN7 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rundc1Q0VDN7 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Rundc1Q0VDN7 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rundc1Q0VDN7 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rundc1Q0VDN7 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rundc1Q0VDN7 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Rundc1Q0VDN7 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rundc1Q0VDN7 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rundc1Q0VDN7 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rundc1Q0VDN7 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rundc1Q0VDN7 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rundc1Q0VDN7 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rundc1Q0VDN7 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rundc1Q0VDN7 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rundc1Q0VDN7 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rundc1Q0VDN7 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rundc1Q0VDN7 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rundc1Q0VDN7 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rundc1Q0VDN7 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rundc1Q0VDN7 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rundc1Q0VDN7 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rundc1Q0VDN7 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rundc1Q0VDN7 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rundc1Q0VDN7 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rundc1Q0VDN7 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rundc1Q0VDN7 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rundc1Q0VDN7 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rundc1Q0VDN7 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rundc1Q0VDN7 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Rundc1Q0VDN7 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Rundc1Q0VDN7 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rundc1Q0VDN7 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Rundc1Q0VDN7 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Rundc1Q0VDN7 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Rundc1Q0VDN7 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rundc1Q0VDN7 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rundc1Q0VDN7 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Rundc1Q0VDN7 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rundc1Q0VDN7 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rundc1Q0VDN7 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rundc1Q0VDN7 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rundc1Q0VDN7 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Rundc1Q0VDN7 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rundc1Q0VDN7 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rundc1Q0VDN7 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rundc1Q0VDN7 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms