Protein–RNA interactions for Protein: Q0PD08

Rab42, Ras-related protein Rab-42, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab42Q0PD08 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rab42Q0PD08 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rab42Q0PD08 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rab42Q0PD08 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rab42Q0PD08 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rab42Q0PD08 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rab42Q0PD08 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rab42Q0PD08 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rab42Q0PD08 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rab42Q0PD08 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rab42Q0PD08 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rab42Q0PD08 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rab42Q0PD08 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rab42Q0PD08 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rab42Q0PD08 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rab42Q0PD08 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Rab42Q0PD08 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rab42Q0PD08 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rab42Q0PD08 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rab42Q0PD08 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rab42Q0PD08 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Rab42Q0PD08 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rab42Q0PD08 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rab42Q0PD08 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rab42Q0PD08 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rab42Q0PD08 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rab42Q0PD08 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rab42Q0PD08 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rab42Q0PD08 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rab42Q0PD08 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rab42Q0PD08 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rab42Q0PD08 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rab42Q0PD08 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rab42Q0PD08 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rab42Q0PD08 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rab42Q0PD08 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rab42Q0PD08 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rab42Q0PD08 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rab42Q0PD08 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rab42Q0PD08 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rab42Q0PD08 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rab42Q0PD08 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rab42Q0PD08 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rab42Q0PD08 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rab42Q0PD08 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rab42Q0PD08 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rab42Q0PD08 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rab42Q0PD08 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rab42Q0PD08 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rab42Q0PD08 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rab42Q0PD08 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Rab42Q0PD08 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Rab42Q0PD08 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rab42Q0PD08 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rab42Q0PD08 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rab42Q0PD08 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rab42Q0PD08 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rab42Q0PD08 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rab42Q0PD08 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rab42Q0PD08 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rab42Q0PD08 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Rab42Q0PD08 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rab42Q0PD08 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rab42Q0PD08 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Rab42Q0PD08 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Rab42Q0PD08 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rab42Q0PD08 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rab42Q0PD08 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rab42Q0PD08 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rab42Q0PD08 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rab42Q0PD08 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rab42Q0PD08 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rab42Q0PD08 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rab42Q0PD08 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rab42Q0PD08 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rab42Q0PD08 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rab42Q0PD08 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rab42Q0PD08 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rab42Q0PD08 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rab42Q0PD08 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rab42Q0PD08 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rab42Q0PD08 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rab42Q0PD08 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rab42Q0PD08 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rab42Q0PD08 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rab42Q0PD08 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rab42Q0PD08 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rab42Q0PD08 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rab42Q0PD08 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rab42Q0PD08 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rab42Q0PD08 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Rab42Q0PD08 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Rab42Q0PD08 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rab42Q0PD08 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rab42Q0PD08 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rab42Q0PD08 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rab42Q0PD08 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rab42Q0PD08 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rab42Q0PD08 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Rab42Q0PD08 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.8 ms