Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5X1

Lrriq1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrriq1Q0P5X1 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lrriq1Q0P5X1 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lrriq1Q0P5X1 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lrriq1Q0P5X1 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lrriq1Q0P5X1 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lrriq1Q0P5X1 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lrriq1Q0P5X1 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lrriq1Q0P5X1 Sun3-202ENSMUST00000102909 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lrriq1Q0P5X1 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lrriq1Q0P5X1 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Lrriq1Q0P5X1 Gm19640-201ENSMUST00000214849 464 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Lrriq1Q0P5X1 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Lrriq1Q0P5X1 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Lrriq1Q0P5X1 Gm8894-201ENSMUST00000074642 666 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Lrriq1Q0P5X1 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lrriq1Q0P5X1 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lrriq1Q0P5X1 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lrriq1Q0P5X1 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lrriq1Q0P5X1 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lrriq1Q0P5X1 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lrriq1Q0P5X1 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Lrriq1Q0P5X1 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lrriq1Q0P5X1 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lrriq1Q0P5X1 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Lrriq1Q0P5X1 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lrriq1Q0P5X1 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lrriq1Q0P5X1 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lrriq1Q0P5X1 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lrriq1Q0P5X1 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Lrriq1Q0P5X1 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lrriq1Q0P5X1 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lrriq1Q0P5X1 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lrriq1Q0P5X1 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lrriq1Q0P5X1 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lrriq1Q0P5X1 Gm42779-201ENSMUST00000198807 406 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Lrriq1Q0P5X1 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lrriq1Q0P5X1 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lrriq1Q0P5X1 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lrriq1Q0P5X1 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lrriq1Q0P5X1 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Lrriq1Q0P5X1 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lrriq1Q0P5X1 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lrriq1Q0P5X1 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lrriq1Q0P5X1 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lrriq1Q0P5X1 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lrriq1Q0P5X1 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lrriq1Q0P5X1 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lrriq1Q0P5X1 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Lrriq1Q0P5X1 AC126799.1-201ENSMUST00000221976 246 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Lrriq1Q0P5X1 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Lrriq1Q0P5X1 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lrriq1Q0P5X1 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lrriq1Q0P5X1 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lrriq1Q0P5X1 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lrriq1Q0P5X1 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lrriq1Q0P5X1 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lrriq1Q0P5X1 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lrriq1Q0P5X1 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lrriq1Q0P5X1 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lrriq1Q0P5X1 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lrriq1Q0P5X1 Gm5621-201ENSMUST00000187303 640 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Lrriq1Q0P5X1 Gm45120-201ENSMUST00000208880 408 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Lrriq1Q0P5X1 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lrriq1Q0P5X1 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Lrriq1Q0P5X1 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lrriq1Q0P5X1 Rpl10-ps3-201ENSMUST00000076364 768 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lrriq1Q0P5X1 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lrriq1Q0P5X1 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lrriq1Q0P5X1 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lrriq1Q0P5X1 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lrriq1Q0P5X1 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lrriq1Q0P5X1 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lrriq1Q0P5X1 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lrriq1Q0P5X1 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lrriq1Q0P5X1 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lrriq1Q0P5X1 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lrriq1Q0P5X1 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Lrriq1Q0P5X1 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lrriq1Q0P5X1 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lrriq1Q0P5X1 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lrriq1Q0P5X1 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lrriq1Q0P5X1 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lrriq1Q0P5X1 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lrriq1Q0P5X1 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lrriq1Q0P5X1 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Lrriq1Q0P5X1 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Lrriq1Q0P5X1 Pbld1-206ENSMUST00000219687 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lrriq1Q0P5X1 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lrriq1Q0P5X1 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lrriq1Q0P5X1 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lrriq1Q0P5X1 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lrriq1Q0P5X1 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lrriq1Q0P5X1 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lrriq1Q0P5X1 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lrriq1Q0P5X1 Mir671-201ENSMUST00000102432 98 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Lrriq1Q0P5X1 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lrriq1Q0P5X1 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Lrriq1Q0P5X1 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Lrriq1Q0P5X1 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lrriq1Q0P5X1 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms