Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5V2

Sobp, Sine oculis-binding protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 864 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SobpQ0P5V2 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SobpQ0P5V2 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SobpQ0P5V2 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SobpQ0P5V2 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SobpQ0P5V2 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SobpQ0P5V2 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SobpQ0P5V2 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SobpQ0P5V2 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SobpQ0P5V2 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SobpQ0P5V2 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SobpQ0P5V2 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SobpQ0P5V2 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SobpQ0P5V2 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SobpQ0P5V2 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SobpQ0P5V2 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SobpQ0P5V2 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SobpQ0P5V2 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SobpQ0P5V2 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SobpQ0P5V2 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SobpQ0P5V2 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SobpQ0P5V2 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SobpQ0P5V2 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SobpQ0P5V2 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SobpQ0P5V2 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SobpQ0P5V2 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SobpQ0P5V2 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SobpQ0P5V2 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SobpQ0P5V2 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SobpQ0P5V2 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SobpQ0P5V2 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SobpQ0P5V2 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SobpQ0P5V2 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SobpQ0P5V2 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SobpQ0P5V2 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SobpQ0P5V2 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SobpQ0P5V2 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SobpQ0P5V2 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SobpQ0P5V2 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SobpQ0P5V2 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SobpQ0P5V2 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SobpQ0P5V2 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SobpQ0P5V2 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SobpQ0P5V2 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SobpQ0P5V2 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SobpQ0P5V2 1700099I09Rik-201ENSMUST00000167834 769 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SobpQ0P5V2 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SobpQ0P5V2 Gm3671-201ENSMUST00000182463 1007 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SobpQ0P5V2 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SobpQ0P5V2 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SobpQ0P5V2 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SobpQ0P5V2 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SobpQ0P5V2 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SobpQ0P5V2 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SobpQ0P5V2 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SobpQ0P5V2 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SobpQ0P5V2 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SobpQ0P5V2 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SobpQ0P5V2 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SobpQ0P5V2 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SobpQ0P5V2 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SobpQ0P5V2 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SobpQ0P5V2 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SobpQ0P5V2 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SobpQ0P5V2 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SobpQ0P5V2 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SobpQ0P5V2 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SobpQ0P5V2 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SobpQ0P5V2 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SobpQ0P5V2 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SobpQ0P5V2 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SobpQ0P5V2 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SobpQ0P5V2 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SobpQ0P5V2 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SobpQ0P5V2 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SobpQ0P5V2 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SobpQ0P5V2 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SobpQ0P5V2 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SobpQ0P5V2 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SobpQ0P5V2 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SobpQ0P5V2 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SobpQ0P5V2 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SobpQ0P5V2 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SobpQ0P5V2 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SobpQ0P5V2 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SobpQ0P5V2 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SobpQ0P5V2 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SobpQ0P5V2 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SobpQ0P5V2 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SobpQ0P5V2 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SobpQ0P5V2 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SobpQ0P5V2 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SobpQ0P5V2 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SobpQ0P5V2 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SobpQ0P5V2 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SobpQ0P5V2 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SobpQ0P5V2 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SobpQ0P5V2 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SobpQ0P5V2 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SobpQ0P5V2 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SobpQ0P5V2 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.6 ms