Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TrioQ0KL02 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TrioQ0KL02 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TrioQ0KL02 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
TrioQ0KL02 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TrioQ0KL02 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TrioQ0KL02 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TrioQ0KL02 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
TrioQ0KL02 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TrioQ0KL02 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TrioQ0KL02 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TrioQ0KL02 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TrioQ0KL02 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TrioQ0KL02 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TrioQ0KL02 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TrioQ0KL02 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TrioQ0KL02 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
TrioQ0KL02 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TrioQ0KL02 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TrioQ0KL02 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TrioQ0KL02 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TrioQ0KL02 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TrioQ0KL02 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TrioQ0KL02 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TrioQ0KL02 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TrioQ0KL02 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TrioQ0KL02 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TrioQ0KL02 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TrioQ0KL02 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TrioQ0KL02 Gm20392-201ENSMUST00000173047 701 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
TrioQ0KL02 1700039I01Rik-201ENSMUST00000194370 479 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
TrioQ0KL02 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TrioQ0KL02 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TrioQ0KL02 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TrioQ0KL02 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TrioQ0KL02 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TrioQ0KL02 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TrioQ0KL02 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
TrioQ0KL02 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TrioQ0KL02 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TrioQ0KL02 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TrioQ0KL02 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
TrioQ0KL02 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TrioQ0KL02 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TrioQ0KL02 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TrioQ0KL02 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TrioQ0KL02 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TrioQ0KL02 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TrioQ0KL02 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TrioQ0KL02 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TrioQ0KL02 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TrioQ0KL02 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TrioQ0KL02 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TrioQ0KL02 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TrioQ0KL02 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TrioQ0KL02 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TrioQ0KL02 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TrioQ0KL02 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TrioQ0KL02 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TrioQ0KL02 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TrioQ0KL02 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TrioQ0KL02 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TrioQ0KL02 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TrioQ0KL02 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
TrioQ0KL02 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TrioQ0KL02 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TrioQ0KL02 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TrioQ0KL02 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
TrioQ0KL02 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TrioQ0KL02 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TrioQ0KL02 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TrioQ0KL02 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TrioQ0KL02 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TrioQ0KL02 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TrioQ0KL02 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TrioQ0KL02 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TrioQ0KL02 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TrioQ0KL02 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TrioQ0KL02 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TrioQ0KL02 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
TrioQ0KL02 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TrioQ0KL02 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TrioQ0KL02 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TrioQ0KL02 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TrioQ0KL02 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TrioQ0KL02 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TrioQ0KL02 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TrioQ0KL02 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TrioQ0KL02 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
TrioQ0KL02 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
TrioQ0KL02 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
TrioQ0KL02 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TrioQ0KL02 Tex30-201ENSMUST00000027215 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TrioQ0KL02 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TrioQ0KL02 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TrioQ0KL02 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TrioQ0KL02 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TrioQ0KL02 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TrioQ0KL02 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TrioQ0KL02 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms