Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ubxn2bQ0KL01 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ubxn2bQ0KL01 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ubxn2bQ0KL01 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ubxn2bQ0KL01 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ubxn2bQ0KL01 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ubxn2bQ0KL01 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ubxn2bQ0KL01 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ubxn2bQ0KL01 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ubxn2bQ0KL01 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ubxn2bQ0KL01 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ubxn2bQ0KL01 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ubxn2bQ0KL01 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ubxn2bQ0KL01 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ubxn2bQ0KL01 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ubxn2bQ0KL01 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ubxn2bQ0KL01 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ubxn2bQ0KL01 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ubxn2bQ0KL01 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ubxn2bQ0KL01 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ubxn2bQ0KL01 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ubxn2bQ0KL01 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ubxn2bQ0KL01 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ubxn2bQ0KL01 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ubxn2bQ0KL01 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ubxn2bQ0KL01 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ubxn2bQ0KL01 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ubxn2bQ0KL01 Anapc16-203ENSMUST00000182152 847 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ubxn2bQ0KL01 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ubxn2bQ0KL01 Gm29083-201ENSMUST00000189205 733 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ubxn2bQ0KL01 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ubxn2bQ0KL01 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ubxn2bQ0KL01 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ubxn2bQ0KL01 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ubxn2bQ0KL01 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ubxn2bQ0KL01 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ubxn2bQ0KL01 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ubxn2bQ0KL01 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ubxn2bQ0KL01 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ubxn2bQ0KL01 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ubxn2bQ0KL01 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ubxn2bQ0KL01 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ubxn2bQ0KL01 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ubxn2bQ0KL01 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ubxn2bQ0KL01 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ubxn2bQ0KL01 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ubxn2bQ0KL01 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ubxn2bQ0KL01 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ubxn2bQ0KL01 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ubxn2bQ0KL01 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ubxn2bQ0KL01 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ubxn2bQ0KL01 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ubxn2bQ0KL01 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ubxn2bQ0KL01 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ubxn2bQ0KL01 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ubxn2bQ0KL01 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ubxn2bQ0KL01 Gm7902-201ENSMUST00000198842 947 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ubxn2bQ0KL01 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ubxn2bQ0KL01 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ubxn2bQ0KL01 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ubxn2bQ0KL01 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ubxn2bQ0KL01 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ubxn2bQ0KL01 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ubxn2bQ0KL01 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ubxn2bQ0KL01 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ubxn2bQ0KL01 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ubxn2bQ0KL01 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ubxn2bQ0KL01 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ubxn2bQ0KL01 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ubxn2bQ0KL01 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ubxn2bQ0KL01 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ubxn2bQ0KL01 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ubxn2bQ0KL01 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ubxn2bQ0KL01 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ubxn2bQ0KL01 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ubxn2bQ0KL01 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ubxn2bQ0KL01 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ubxn2bQ0KL01 Gm13609-201ENSMUST00000141023 589 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ubxn2bQ0KL01 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ubxn2bQ0KL01 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ubxn2bQ0KL01 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ubxn2bQ0KL01 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ubxn2bQ0KL01 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ubxn2bQ0KL01 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ubxn2bQ0KL01 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ubxn2bQ0KL01 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ubxn2bQ0KL01 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ubxn2bQ0KL01 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ubxn2bQ0KL01 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ubxn2bQ0KL01 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ubxn2bQ0KL01 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ubxn2bQ0KL01 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ubxn2bQ0KL01 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubxn2bQ0KL01 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubxn2bQ0KL01 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubxn2bQ0KL01 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubxn2bQ0KL01 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubxn2bQ0KL01 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubxn2bQ0KL01 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubxn2bQ0KL01 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms