Protein–RNA interactions for Protein: Q08423

Tff1, Trefoil factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 87 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff1Q08423 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tff1Q08423 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tff1Q08423 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tff1Q08423 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tff1Q08423 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tff1Q08423 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tff1Q08423 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tff1Q08423 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tff1Q08423 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tff1Q08423 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tff1Q08423 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tff1Q08423 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tff1Q08423 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tff1Q08423 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tff1Q08423 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tff1Q08423 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tff1Q08423 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tff1Q08423 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tff1Q08423 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tff1Q08423 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tff1Q08423 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tff1Q08423 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tff1Q08423 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tff1Q08423 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tff1Q08423 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tff1Q08423 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tff1Q08423 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tff1Q08423 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tff1Q08423 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tff1Q08423 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tff1Q08423 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tff1Q08423 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tff1Q08423 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tff1Q08423 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tff1Q08423 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tff1Q08423 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tff1Q08423 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tff1Q08423 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tff1Q08423 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tff1Q08423 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tff1Q08423 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tff1Q08423 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tff1Q08423 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tff1Q08423 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tff1Q08423 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Tff1Q08423 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tff1Q08423 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tff1Q08423 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tff1Q08423 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tff1Q08423 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Tff1Q08423 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tff1Q08423 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Tff1Q08423 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tff1Q08423 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tff1Q08423 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tff1Q08423 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Tff1Q08423 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tff1Q08423 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tff1Q08423 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tff1Q08423 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tff1Q08423 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tff1Q08423 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tff1Q08423 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tff1Q08423 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tff1Q08423 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tff1Q08423 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tff1Q08423 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tff1Q08423 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tff1Q08423 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tff1Q08423 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tff1Q08423 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tff1Q08423 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tff1Q08423 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Tff1Q08423 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tff1Q08423 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tff1Q08423 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tff1Q08423 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tff1Q08423 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tff1Q08423 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tff1Q08423 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tff1Q08423 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tff1Q08423 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Tff1Q08423 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tff1Q08423 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tff1Q08423 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tff1Q08423 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tff1Q08423 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tff1Q08423 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tff1Q08423 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Tff1Q08423 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tff1Q08423 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Tff1Q08423 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tff1Q08423 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tff1Q08423 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tff1Q08423 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tff1Q08423 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tff1Q08423 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tff1Q08423 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Tff1Q08423 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tff1Q08423 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms