Protein–RNA interactions for Protein: Q07646

Mest, Mesoderm-specific transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MestQ07646 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
MestQ07646 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
MestQ07646 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
MestQ07646 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
MestQ07646 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
MestQ07646 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
MestQ07646 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
MestQ07646 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
MestQ07646 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
MestQ07646 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
MestQ07646 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
MestQ07646 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
MestQ07646 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
MestQ07646 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
MestQ07646 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
MestQ07646 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
MestQ07646 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
MestQ07646 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
MestQ07646 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
MestQ07646 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
MestQ07646 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
MestQ07646 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
MestQ07646 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
MestQ07646 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
MestQ07646 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
MestQ07646 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
MestQ07646 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
MestQ07646 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
MestQ07646 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
MestQ07646 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
MestQ07646 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
MestQ07646 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
MestQ07646 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
MestQ07646 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
MestQ07646 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
MestQ07646 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
MestQ07646 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
MestQ07646 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
MestQ07646 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
MestQ07646 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
MestQ07646 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
MestQ07646 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
MestQ07646 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
MestQ07646 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
MestQ07646 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
MestQ07646 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
MestQ07646 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
MestQ07646 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
MestQ07646 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
MestQ07646 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
MestQ07646 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
MestQ07646 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
MestQ07646 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
MestQ07646 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
MestQ07646 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
MestQ07646 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
MestQ07646 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
MestQ07646 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
MestQ07646 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
MestQ07646 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
MestQ07646 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
MestQ07646 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
MestQ07646 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
MestQ07646 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
MestQ07646 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
MestQ07646 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
MestQ07646 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
MestQ07646 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
MestQ07646 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
MestQ07646 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
MestQ07646 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
MestQ07646 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
MestQ07646 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
MestQ07646 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
MestQ07646 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
MestQ07646 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
MestQ07646 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
MestQ07646 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
MestQ07646 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
MestQ07646 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
MestQ07646 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
MestQ07646 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
MestQ07646 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
MestQ07646 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
MestQ07646 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
MestQ07646 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
MestQ07646 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
MestQ07646 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
MestQ07646 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
MestQ07646 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
MestQ07646 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
MestQ07646 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
MestQ07646 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
MestQ07646 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
MestQ07646 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
MestQ07646 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
MestQ07646 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
MestQ07646 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
MestQ07646 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
MestQ07646 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms