Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Siah1bQ06985 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Siah1bQ06985 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Siah1bQ06985 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Siah1bQ06985 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Siah1bQ06985 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Siah1bQ06985 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Siah1bQ06985 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Siah1bQ06985 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Siah1bQ06985 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Siah1bQ06985 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Siah1bQ06985 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Siah1bQ06985 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Siah1bQ06985 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Siah1bQ06985 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Siah1bQ06985 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Siah1bQ06985 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Siah1bQ06985 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Siah1bQ06985 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Siah1bQ06985 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Siah1bQ06985 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Siah1bQ06985 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Siah1bQ06985 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Siah1bQ06985 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Siah1bQ06985 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Siah1bQ06985 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Siah1bQ06985 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Siah1bQ06985 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Siah1bQ06985 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Siah1bQ06985 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Siah1bQ06985 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Siah1bQ06985 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Siah1bQ06985 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Siah1bQ06985 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Siah1bQ06985 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Siah1bQ06985 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Siah1bQ06985 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Siah1bQ06985 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Siah1bQ06985 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Siah1bQ06985 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Siah1bQ06985 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Siah1bQ06985 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Siah1bQ06985 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Siah1bQ06985 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Siah1bQ06985 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Siah1bQ06985 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Siah1bQ06985 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Siah1bQ06985 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Siah1bQ06985 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Siah1bQ06985 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Siah1bQ06985 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Siah1bQ06985 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Siah1bQ06985 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Siah1bQ06985 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Siah1bQ06985 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Siah1bQ06985 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Siah1bQ06985 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Siah1bQ06985 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Siah1bQ06985 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Siah1bQ06985 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Siah1bQ06985 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Siah1bQ06985 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Siah1bQ06985 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Siah1bQ06985 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Siah1bQ06985 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Siah1bQ06985 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Siah1bQ06985 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Siah1bQ06985 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Siah1bQ06985 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Siah1bQ06985 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Siah1bQ06985 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Siah1bQ06985 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Siah1bQ06985 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Siah1bQ06985 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Siah1bQ06985 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Siah1bQ06985 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Siah1bQ06985 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Siah1bQ06985 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Siah1bQ06985 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Siah1bQ06985 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Siah1bQ06985 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Siah1bQ06985 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Siah1bQ06985 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Siah1bQ06985 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Siah1bQ06985 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Siah1bQ06985 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Siah1bQ06985 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Siah1bQ06985 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Siah1bQ06985 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Siah1bQ06985 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Siah1bQ06985 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Siah1bQ06985 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Siah1bQ06985 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Siah1bQ06985 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Siah1bQ06985 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Siah1bQ06985 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Siah1bQ06985 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Siah1bQ06985 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Siah1bQ06985 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Siah1bQ06985 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms