Protein–RNA interactions for Protein: Q03717

Kcnb1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnb1Q03717 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Kcnb1Q03717 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kcnb1Q03717 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Kcnb1Q03717 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Kcnb1Q03717 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kcnb1Q03717 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Kcnb1Q03717 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Kcnb1Q03717 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kcnb1Q03717 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Kcnb1Q03717 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Kcnb1Q03717 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Kcnb1Q03717 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kcnb1Q03717 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kcnb1Q03717 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Kcnb1Q03717 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Kcnb1Q03717 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kcnb1Q03717 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kcnb1Q03717 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kcnb1Q03717 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Kcnb1Q03717 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kcnb1Q03717 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Kcnb1Q03717 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Kcnb1Q03717 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Kcnb1Q03717 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Kcnb1Q03717 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Kcnb1Q03717 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Kcnb1Q03717 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Kcnb1Q03717 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Kcnb1Q03717 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Kcnb1Q03717 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Kcnb1Q03717 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Kcnb1Q03717 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Kcnb1Q03717 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Kcnb1Q03717 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Kcnb1Q03717 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Kcnb1Q03717 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Kcnb1Q03717 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Kcnb1Q03717 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Kcnb1Q03717 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Kcnb1Q03717 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Kcnb1Q03717 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Kcnb1Q03717 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Kcnb1Q03717 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Kcnb1Q03717 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Kcnb1Q03717 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Kcnb1Q03717 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Kcnb1Q03717 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Kcnb1Q03717 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Kcnb1Q03717 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Kcnb1Q03717 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Kcnb1Q03717 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Kcnb1Q03717 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kcnb1Q03717 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Kcnb1Q03717 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kcnb1Q03717 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kcnb1Q03717 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kcnb1Q03717 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Kcnb1Q03717 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kcnb1Q03717 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Kcnb1Q03717 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Kcnb1Q03717 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Kcnb1Q03717 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Kcnb1Q03717 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Kcnb1Q03717 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kcnb1Q03717 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Kcnb1Q03717 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Kcnb1Q03717 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Kcnb1Q03717 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kcnb1Q03717 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kcnb1Q03717 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kcnb1Q03717 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Kcnb1Q03717 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Kcnb1Q03717 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kcnb1Q03717 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kcnb1Q03717 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kcnb1Q03717 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Kcnb1Q03717 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kcnb1Q03717 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kcnb1Q03717 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Kcnb1Q03717 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kcnb1Q03717 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kcnb1Q03717 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kcnb1Q03717 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kcnb1Q03717 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Kcnb1Q03717 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kcnb1Q03717 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kcnb1Q03717 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kcnb1Q03717 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kcnb1Q03717 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kcnb1Q03717 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kcnb1Q03717 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Kcnb1Q03717 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Kcnb1Q03717 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kcnb1Q03717 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kcnb1Q03717 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Kcnb1Q03717 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kcnb1Q03717 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kcnb1Q03717 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kcnb1Q03717 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kcnb1Q03717 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms