Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC9.62□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC9.62□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.61□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC9.61□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC9.61□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms