Protein–RNA interactions for Protein: Q00262

Stx2, Syntaxin-2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx2Q00262 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Stx2Q00262 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Stx2Q00262 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Stx2Q00262 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Stx2Q00262 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Stx2Q00262 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Stx2Q00262 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Stx2Q00262 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Stx2Q00262 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Stx2Q00262 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Stx2Q00262 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Stx2Q00262 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Stx2Q00262 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Stx2Q00262 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Stx2Q00262 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Stx2Q00262 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Stx2Q00262 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Stx2Q00262 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Stx2Q00262 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Stx2Q00262 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Stx2Q00262 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Stx2Q00262 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Stx2Q00262 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Stx2Q00262 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Stx2Q00262 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Stx2Q00262 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Stx2Q00262 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Stx2Q00262 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Stx2Q00262 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Stx2Q00262 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Stx2Q00262 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Stx2Q00262 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Stx2Q00262 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Stx2Q00262 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Stx2Q00262 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Stx2Q00262 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Stx2Q00262 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Stx2Q00262 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Stx2Q00262 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Stx2Q00262 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Stx2Q00262 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Stx2Q00262 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Stx2Q00262 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Stx2Q00262 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Stx2Q00262 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Stx2Q00262 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Stx2Q00262 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Stx2Q00262 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Stx2Q00262 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Stx2Q00262 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Stx2Q00262 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Stx2Q00262 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Stx2Q00262 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Stx2Q00262 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Stx2Q00262 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Stx2Q00262 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Stx2Q00262 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Stx2Q00262 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Stx2Q00262 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Stx2Q00262 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Stx2Q00262 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Stx2Q00262 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Stx2Q00262 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Stx2Q00262 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Stx2Q00262 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Stx2Q00262 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Stx2Q00262 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Stx2Q00262 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Stx2Q00262 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Stx2Q00262 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Stx2Q00262 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Stx2Q00262 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Stx2Q00262 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Stx2Q00262 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Stx2Q00262 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Stx2Q00262 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Stx2Q00262 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Stx2Q00262 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Stx2Q00262 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Stx2Q00262 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Stx2Q00262 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Stx2Q00262 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Stx2Q00262 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Stx2Q00262 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Stx2Q00262 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Stx2Q00262 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Stx2Q00262 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Stx2Q00262 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Stx2Q00262 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Stx2Q00262 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Stx2Q00262 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Stx2Q00262 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Stx2Q00262 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Stx2Q00262 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Stx2Q00262 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Stx2Q00262 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Stx2Q00262 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Stx2Q00262 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Stx2Q00262 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Stx2Q00262 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms