Protein–RNA interactions for Protein: P97793

Alk, ALK tyrosine kinase receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AlkP97793 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
AlkP97793 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
AlkP97793 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
AlkP97793 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
AlkP97793 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
AlkP97793 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
AlkP97793 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
AlkP97793 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
AlkP97793 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
AlkP97793 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
AlkP97793 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
AlkP97793 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
AlkP97793 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
AlkP97793 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
AlkP97793 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
AlkP97793 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
AlkP97793 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
AlkP97793 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
AlkP97793 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
AlkP97793 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
AlkP97793 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
AlkP97793 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
AlkP97793 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
AlkP97793 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
AlkP97793 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
AlkP97793 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
AlkP97793 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
AlkP97793 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
AlkP97793 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
AlkP97793 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
AlkP97793 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
AlkP97793 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
AlkP97793 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
AlkP97793 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
AlkP97793 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
AlkP97793 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
AlkP97793 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
AlkP97793 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
AlkP97793 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
AlkP97793 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
AlkP97793 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
AlkP97793 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
AlkP97793 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
AlkP97793 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
AlkP97793 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
AlkP97793 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
AlkP97793 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
AlkP97793 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
AlkP97793 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
AlkP97793 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
AlkP97793 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
AlkP97793 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
AlkP97793 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
AlkP97793 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
AlkP97793 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
AlkP97793 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
AlkP97793 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
AlkP97793 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
AlkP97793 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
AlkP97793 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
AlkP97793 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
AlkP97793 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
AlkP97793 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
AlkP97793 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
AlkP97793 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
AlkP97793 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
AlkP97793 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
AlkP97793 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
AlkP97793 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
AlkP97793 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
AlkP97793 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
AlkP97793 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
AlkP97793 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
AlkP97793 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
AlkP97793 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
AlkP97793 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
AlkP97793 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
AlkP97793 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
AlkP97793 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
AlkP97793 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
AlkP97793 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
AlkP97793 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
AlkP97793 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
AlkP97793 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
AlkP97793 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
AlkP97793 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
AlkP97793 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
AlkP97793 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
AlkP97793 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
AlkP97793 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
AlkP97793 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
AlkP97793 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
AlkP97793 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
AlkP97793 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
AlkP97793 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
AlkP97793 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
AlkP97793 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
AlkP97793 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
AlkP97793 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
AlkP97793 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms