Protein–RNA interactions for Protein: P97452

Bop1, Ribosome biogenesis protein BOP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 732 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bop1P97452 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Bop1P97452 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Bop1P97452 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Bop1P97452 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Bop1P97452 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Bop1P97452 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Bop1P97452 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Bop1P97452 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Bop1P97452 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Bop1P97452 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Bop1P97452 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Bop1P97452 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Bop1P97452 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Bop1P97452 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Bop1P97452 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Bop1P97452 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Bop1P97452 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Bop1P97452 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Bop1P97452 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Bop1P97452 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Bop1P97452 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Bop1P97452 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Bop1P97452 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Bop1P97452 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Bop1P97452 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Bop1P97452 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Bop1P97452 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Bop1P97452 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Bop1P97452 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Bop1P97452 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Bop1P97452 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Bop1P97452 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Bop1P97452 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Bop1P97452 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Bop1P97452 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Bop1P97452 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Bop1P97452 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Bop1P97452 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Bop1P97452 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Bop1P97452 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Bop1P97452 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Bop1P97452 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Bop1P97452 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Bop1P97452 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Bop1P97452 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Bop1P97452 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Bop1P97452 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Bop1P97452 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Bop1P97452 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Bop1P97452 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Bop1P97452 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Bop1P97452 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Bop1P97452 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Bop1P97452 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Bop1P97452 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Bop1P97452 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Bop1P97452 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Bop1P97452 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Bop1P97452 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Bop1P97452 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Bop1P97452 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Bop1P97452 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Bop1P97452 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Bop1P97452 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Bop1P97452 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Bop1P97452 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Bop1P97452 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Bop1P97452 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Bop1P97452 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Bop1P97452 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Bop1P97452 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Bop1P97452 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Bop1P97452 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Bop1P97452 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Bop1P97452 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Bop1P97452 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Bop1P97452 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Bop1P97452 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Bop1P97452 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Bop1P97452 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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