Protein–RNA interactions for Protein: P70298

Cux2, Homeobox protein cut-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,426 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux2P70298 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cux2P70298 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cux2P70298 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cux2P70298 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cux2P70298 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cux2P70298 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cux2P70298 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cux2P70298 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cux2P70298 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cux2P70298 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Cux2P70298 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cux2P70298 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cux2P70298 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cux2P70298 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cux2P70298 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Cux2P70298 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Cux2P70298 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cux2P70298 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cux2P70298 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cux2P70298 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Cux2P70298 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cux2P70298 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Cux2P70298 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cux2P70298 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cux2P70298 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cux2P70298 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cux2P70298 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cux2P70298 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cux2P70298 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cux2P70298 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cux2P70298 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Cux2P70298 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cux2P70298 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cux2P70298 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cux2P70298 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Cux2P70298 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cux2P70298 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Cux2P70298 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Cux2P70298 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Cux2P70298 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cux2P70298 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cux2P70298 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cux2P70298 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cux2P70298 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cux2P70298 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cux2P70298 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cux2P70298 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cux2P70298 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cux2P70298 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cux2P70298 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cux2P70298 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cux2P70298 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cux2P70298 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cux2P70298 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cux2P70298 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Cux2P70298 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cux2P70298 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cux2P70298 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Cux2P70298 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Cux2P70298 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cux2P70298 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cux2P70298 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cux2P70298 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cux2P70298 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cux2P70298 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cux2P70298 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cux2P70298 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cux2P70298 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cux2P70298 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cux2P70298 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cux2P70298 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cux2P70298 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cux2P70298 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cux2P70298 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cux2P70298 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cux2P70298 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cux2P70298 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cux2P70298 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cux2P70298 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cux2P70298 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cux2P70298 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Cux2P70298 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cux2P70298 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cux2P70298 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cux2P70298 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cux2P70298 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cux2P70298 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cux2P70298 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cux2P70298 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cux2P70298 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cux2P70298 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cux2P70298 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Cux2P70298 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cux2P70298 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cux2P70298 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cux2P70298 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cux2P70298 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cux2P70298 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cux2P70298 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cux2P70298 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
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