Protein–RNA interactions for Protein: P70255

Nfic, Nuclear factor 1 C-type, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NficP70255 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NficP70255 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NficP70255 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NficP70255 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NficP70255 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NficP70255 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NficP70255 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NficP70255 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NficP70255 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NficP70255 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NficP70255 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NficP70255 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NficP70255 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NficP70255 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NficP70255 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NficP70255 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
NficP70255 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NficP70255 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NficP70255 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NficP70255 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NficP70255 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
NficP70255 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NficP70255 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NficP70255 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NficP70255 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NficP70255 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NficP70255 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NficP70255 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NficP70255 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NficP70255 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NficP70255 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NficP70255 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NficP70255 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NficP70255 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NficP70255 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NficP70255 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NficP70255 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NficP70255 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NficP70255 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NficP70255 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NficP70255 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NficP70255 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NficP70255 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NficP70255 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NficP70255 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NficP70255 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NficP70255 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NficP70255 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
NficP70255 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NficP70255 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
NficP70255 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
NficP70255 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NficP70255 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NficP70255 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NficP70255 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NficP70255 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NficP70255 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NficP70255 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NficP70255 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NficP70255 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NficP70255 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NficP70255 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NficP70255 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NficP70255 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NficP70255 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NficP70255 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NficP70255 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NficP70255 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NficP70255 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NficP70255 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NficP70255 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NficP70255 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NficP70255 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NficP70255 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NficP70255 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NficP70255 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NficP70255 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NficP70255 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NficP70255 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NficP70255 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NficP70255 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NficP70255 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NficP70255 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NficP70255 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NficP70255 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
NficP70255 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NficP70255 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NficP70255 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
NficP70255 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
NficP70255 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NficP70255 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NficP70255 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NficP70255 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NficP70255 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NficP70255 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
NficP70255 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NficP70255 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NficP70255 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NficP70255 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
NficP70255 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms