Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hoxd13P70217 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hoxd13P70217 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hoxd13P70217 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hoxd13P70217 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hoxd13P70217 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hoxd13P70217 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hoxd13P70217 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hoxd13P70217 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hoxd13P70217 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hoxd13P70217 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hoxd13P70217 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hoxd13P70217 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hoxd13P70217 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hoxd13P70217 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hoxd13P70217 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hoxd13P70217 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hoxd13P70217 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hoxd13P70217 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hoxd13P70217 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hoxd13P70217 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hoxd13P70217 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hoxd13P70217 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hoxd13P70217 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
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Hoxd13P70217 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hoxd13P70217 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hoxd13P70217 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
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Hoxd13P70217 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
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Hoxd13P70217 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hoxd13P70217 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hoxd13P70217 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hoxd13P70217 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hoxd13P70217 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hoxd13P70217 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hoxd13P70217 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hoxd13P70217 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hoxd13P70217 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hoxd13P70217 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hoxd13P70217 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
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Hoxd13P70217 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hoxd13P70217 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hoxd13P70217 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hoxd13P70217 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hoxd13P70217 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hoxd13P70217 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hoxd13P70217 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hoxd13P70217 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
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Hoxd13P70217 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hoxd13P70217 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hoxd13P70217 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hoxd13P70217 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hoxd13P70217 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hoxd13P70217 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hoxd13P70217 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hoxd13P70217 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hoxd13P70217 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hoxd13P70217 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hoxd13P70217 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hoxd13P70217 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hoxd13P70217 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hoxd13P70217 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hoxd13P70217 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hoxd13P70217 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hoxd13P70217 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hoxd13P70217 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hoxd13P70217 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hoxd13P70217 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hoxd13P70217 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hoxd13P70217 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Hoxd13P70217 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hoxd13P70217 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hoxd13P70217 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Hoxd13P70217 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hoxd13P70217 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Hoxd13P70217 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hoxd13P70217 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
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