Protein–RNA interactions for Protein: P62748

Hpcal1, Hippocalcin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpcal1P62748 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hpcal1P62748 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hpcal1P62748 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hpcal1P62748 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hpcal1P62748 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hpcal1P62748 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hpcal1P62748 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Hpcal1P62748 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Hpcal1P62748 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hpcal1P62748 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hpcal1P62748 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hpcal1P62748 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hpcal1P62748 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hpcal1P62748 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hpcal1P62748 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hpcal1P62748 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hpcal1P62748 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hpcal1P62748 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Hpcal1P62748 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Hpcal1P62748 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hpcal1P62748 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hpcal1P62748 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hpcal1P62748 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hpcal1P62748 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Hpcal1P62748 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Hpcal1P62748 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hpcal1P62748 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hpcal1P62748 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hpcal1P62748 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hpcal1P62748 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hpcal1P62748 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hpcal1P62748 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hpcal1P62748 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hpcal1P62748 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hpcal1P62748 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Hpcal1P62748 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hpcal1P62748 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hpcal1P62748 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hpcal1P62748 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hpcal1P62748 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hpcal1P62748 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hpcal1P62748 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hpcal1P62748 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hpcal1P62748 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hpcal1P62748 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hpcal1P62748 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hpcal1P62748 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hpcal1P62748 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hpcal1P62748 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hpcal1P62748 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hpcal1P62748 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hpcal1P62748 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hpcal1P62748 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hpcal1P62748 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hpcal1P62748 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hpcal1P62748 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hpcal1P62748 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hpcal1P62748 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hpcal1P62748 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Hpcal1P62748 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hpcal1P62748 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hpcal1P62748 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hpcal1P62748 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hpcal1P62748 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hpcal1P62748 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hpcal1P62748 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Hpcal1P62748 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Hpcal1P62748 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Hpcal1P62748 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Hpcal1P62748 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hpcal1P62748 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hpcal1P62748 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hpcal1P62748 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hpcal1P62748 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hpcal1P62748 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hpcal1P62748 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hpcal1P62748 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hpcal1P62748 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hpcal1P62748 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hpcal1P62748 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hpcal1P62748 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hpcal1P62748 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hpcal1P62748 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hpcal1P62748 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hpcal1P62748 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hpcal1P62748 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hpcal1P62748 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hpcal1P62748 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hpcal1P62748 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hpcal1P62748 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hpcal1P62748 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Hpcal1P62748 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hpcal1P62748 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hpcal1P62748 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hpcal1P62748 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hpcal1P62748 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hpcal1P62748 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hpcal1P62748 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hpcal1P62748 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hpcal1P62748 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms