Protein–RNA interactions for Protein: P61969

Lmo4, LIM domain transcription factor LMO4, mousemouse

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Length 165 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo4P61969 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Lmo4P61969 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Lmo4P61969 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Lmo4P61969 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Lmo4P61969 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Lmo4P61969 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Lmo4P61969 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Lmo4P61969 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms